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背景及目的:Rab家族蛋白在调控囊泡运输过程中发挥着重要作用,其中一些Rab蛋白的突变被发现会导致疾病的发生。目前已经鉴定出60多种人类Rab家族蛋白,但是其中很多Rab蛋白的生理功能尚不清楚。RAB39B作为Rab家族的一员,在神经元中特异性表达。虽然有细胞研究提示RAB39B在神经元膜蛋白转运过程中发挥作用,并参与神经突触的形成和维持,而且RAB39B可能也参与了自噬。但是现在关于RAB39B的功能,特别是在动物整体水平的功能还不清楚。最近的研究发现发生在RAB39B编码基因上的突变与X染色体相关的智力障碍、帕金森病、自闭症等有密切相关,但是相关机制目前还不明瞭。因此迫切需要揭示RAB39B的生理和病理功能,为疾病的发病机制研究和治疗提供新的依据。方法及结果:在本研究中,我们应用TALEN技术构建了Rab3 b基因敲除的小鼠,并证实了该小鼠中没有RAB39B蛋白的表达。初步观察发现Rab39b基因敲除的小鼠能够正常出生,并在外观上无明显缺陷。我们进一步应用RNA-seq研究了Rab3 b基因缺失对于大脑中其他基因表达的影响,结果鉴定出30个显著上调的基因和31个显著下调的基因。这些基因大多数为非蛋白编码RNA,只有9个是已知的蛋白编码基因。GO分析显示这些受到影响的基因在细胞中可能参与了细胞膜和细胞器结构;在生物过程中可能参与了定位;而在分子功能中可能具有结合、催化和转运的作用。KEGG分析提示这些基因可能参与了多种疾病如肿瘤、免疫、感染等,并参与了代谢。不过当我们对9个已知蛋白编码基因的表达进行验证时,只能证实Hist2h3c1的表达的确在Rab39b基因敲除小鼠中发生下降。结论:这些结果暗示着Rab39b的缺失对于蛋白编码基因的表达没有明显影响,可能更多地是在蛋白互作水平上影响其他蛋白的功能作用。我们构建的Rab39b基因敲除小鼠和初步的基因表达分析研究为进一步揭示RAB39B的生理功能和病理作用奠定了基础。