本体驱动的出院小结现病史结构化研究与实现

来源 :东华大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhang_yingliang
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随着医院信息化建设的不断完善,电子病历系统的使用也越来越普遍,由此积累了大量的医疗数据资源。出院小结现病史是这些医疗数据资源的重要组成部分之一,记录了住院患者的健康状况以及诊疗过程,蕴含着丰富的医学知识。然而,出院小结现病史是一种非结构化的叙述性医疗文本,很难直接应用机器学习或深度学习模型进行数据挖掘与分析,在一定程度上阻碍了医疗数据的再次利用。因此,对出院小结现病史进行结构化处理,有助于发掘数据的潜在价值,使之更好地为医疗数据研究工作提供服务。本文以上海某三甲医院提供的出院小结现病史为数据基础展开研究,提出了一种本体驱动的出院小结现病史结构化方法。本文的主要工作如下:(1)基于医疗数据的专业性和特殊性,本文通过从医学专业资料中收集词汇和从健康网站上爬取数据两种方式构建专业词典,然后使用专业词典辅助分词工具,提高分词准确率,保证本体质量和文本结构化效果。(2)本文提出了一种构建出院小结现病史本体的方法。首先对出院小结现病史进行数据预处理,主要包括数据清洗和文本切分;然后根据出院小结现病史的数据特点,构建了本体基础框架;为了方便本体的扩展和维护,将现病史本体分解为四个子本体来构建,以描述块拆分后的单句为基本处理单位,采用词典匹配的方式识别实体及其属性,填充到各个子本体中,最后合并子本体,完成出院小结现病史本体的构建。(3)本文提出了一种本体驱动的出院小结现病史结构化方法。首先利用正则表达式和一组启发式规则识别现病史中的时间;然后根据时间分段算法对现病史进行分段,并在此基础上进行文本切分,得到不同的描述块;接下来将描述块拆分为单句,把单句和对应的子本体作为基本处理单位,通过获取分支子树路径算法和生成语义子树算法,得到与出院小结现病史对应的时间轴语义子树。最后将XML存储的语义子树转换为关系型文件存储的出院小结现病史结构化数据。(4)本文设计并实现了出院小结现病史结构化可视系统。从实际需求出发,将本文提出的结构化方法嵌入到系统中,设计并实现了系统的各个功能模块,主要包括结构化功能模块、结构化结果可视模块、词库管理功能模块等。综上,本文首先构建了出院小结现病史本体,然后提出了一种本体驱动的结构化方法,通过对比实验,验证了本文方法的有效性和准确性,最后设计并实现了一套出院小结现病史结构化可视系统。
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