随着我国政府职能加快转变，原来“政府替代市场”的职能需要交给市场，而原属于商会的管理职能要交还商会。政府的职能转变和商会的发展是并行的，在计划经济体制下，我国政府承担了全部经济职能，在市场经济条件下，需要商会等中介组织来填补政府职能转变所带来的空间，发挥在市场经济中的协调、规范作用，避免因政府职能转变而形成“真空”，引发无序竞争。
　　
　　将应属于商会的事权还给商会
　　
　　商会的培育与完善无疑是政府职能转变的一个现实切入点。政府应将行业协调、企业指导与监督以及市场准入等部分职能适当交给商会。商会在这些领域也可发挥更大的作用。具体涉及这样一些方面
　　第一，部分行业协调职能和市场协调职能可转交给商会。如将行业规划、行规的制定与监督、行业标准的制定与修订、行业生产经营许可证发放等职能可交给行业协会。
　　第二，由于在市场经济条件下，政府不再直接干预企业的行为，而企业内外关系的维护、市场环境的整治、行业产品价格的制定、竞争行业的规范也应适当交给商会来办理。
　　第三，为广大会员企业提供优质服务是商会的一项重要职能。商会的中介性特点决定了商会必须建立自己的服务性机构，建立为会员服务的渠道和方式，包括为会员企业提供信息、出具各类证明、开展市场调查、举办展销会等。另外商会还提供技术、金融、会计、环保、法律等多方面的咨询活动。在政府职能转变中，凡政府还承担上述职能的，应尽快将其转交给商会。
　　第四，在市场经济条件下，由于信息不对称、自身能力的限制以及受利益最大化的驱使，民营企业常常出现短期行为，缺乏发展战略和长期投资计划，缺乏品牌意识，因此，引导民营企业走可持续发展之路，树立品牌意识，就成为商会的重要职责。商会还应通过积极倡导诚实信用之风，促进成员企业的相互监督。
　　第五，要把维权职能交给商会。由于中小民营企业势单力薄，难以应对强大的市场竞争压力，也难以确保自身权益不受侵犯，商会可以维护行业的整体利益，保护会员企业的权益不受侵犯。
　　第六，要把部分市场准入权交给商会。为了维护市场竞争秩序，把好市场准入关是非常必要的。市场经济发达国家的企业在进入市场时要向当地商会提出申请，并接受商会的约束和保护。我国可惜鉴国外的做法，将市场准入的注册登记等交由商会办理。
　　
　　建立政府与商会的良性互动机制
　　
　　在政府职能转变过程中，商会要切实加强自身建设，才有可能承接政府经济职能的部分转移。我国商会发育程度非常低，专业人才特别是熟知世贸组织贸易规则的人才缺口较大，加上资金短缺等因素，商会在短时间内还缺乏承接政府转移职能的能力。因此，政府在职能转变过程中，商会应注重提高自身素质，树立商会在行业中的威信，关键是塑造其对市场经济的适应能力。具体来看包括这样一些方面
　　首先，商会应加强独立性和自主性建设。商会本质上是一个独立的民间社团法人组织，独立性和自主性是商会充分发挥其职能的前提。目前我国商会的独立性和自主性欠缺，对政府的依赖性很强，其职能的发挥很大程度上还要依靠政府。在这种情况下，即使政府要把职能转交给商会，商会也没有能力承接好。
　　其次，商会在自身组织建设中应尽快实现民间化，要以为企业服务为最高宗旨。如果商会仅仅是政府机构和权力的延伸，就失去了存在的意义，也不可能很好地承接政府转交的职能。
　　第三，加强制度建设。商会要进一步建立健全选举制度、议事制度、财务制度，靠制度办会，靠制度管人。
　　第四，加大人才培养力度，要采取多种措施，通过多种途径培养高素质的、熟悉具体业务和世贸组织规则的人才，更好地保护会员的利益和为会员提供良好的服务。
　　第五，政府应为商会的发展创造良好的法制环境与空间，规范商会的行为。我国目前还没有商会法，为此应尽快参照各国的有关立法和规章，制定适合我国国情的商会法。在国家尚未出台商会法之前，各地要尽快建立起商会的相应管理法规和章程，待时机成熟再出台全国统一的商会法。目前政府对商会的发展要予以适当扶持，形成互动机制，但关键还是要靠商会自身的服务能力增强，成为真正有益于市场经济秩序建设的中介服务组织，最终赢得市场经济主体的支持。