2020年我国爆发了新型冠状肺炎,疫情传播速度快、传染性强,死亡率高并且没有特效药。疫情发生后,引起了全国人民乃至世界各国的关注,国家迅速启动了应急预案,采取了相应的防护措施。账目不清、管理不善是整个应急物资过程中,不可避免的情况。对应急物资的情况进行监督并且对外公告是审计机关的责任,这不仅是受托经济责任的体现,也是国家保障人民利益、回应社会爱心的重要措施。然而,对于应急物资收集的合规性、发放的合理性和使用的合法性,中国还没有一个系统、完善的审计和评估体系对其进行评估。因此,寻找合适的审计方法,构建一套完整的应急物资跟踪审计评价体系,对于当前疫情防控常态化和国家治理现代化背景下开展审计工作是十分必要的。本文以新冠疫情为研究背景,首先介绍理论基础和相关概念,包括受托责任、免疫系统和国家审计等相关理论,跟踪审计、重大突发事件等概念;其次,梳理了我国以往跟踪审计的相关研究及实例,分析了我国应急物资跟踪审计的现状,主要包括应急物资跟踪审计的现状分析和存在的问题、应急物资跟踪审计评价体系存在的问题以及问题原因,以便对应急物资跟踪审计评价指标体系进行更好的研究;再次,根据评价指标选取的原则,从形式、事实、价值三个维度构建应急物资跟踪审计评价指标体系;最后再以H省为例,对H省应急物资的全过程进行评价,得出评价结果,对案例进行总结,并针对应急物资跟踪审计存在的问题提出相应的建议,得出研究结论:要加强对应急物资跟踪审计体系的研究;本文构建的评价体系在实际运用过程中做出相应的调整;要加快出台相关的法律法规,完善审计评价体系。本文对重大突发事件跟踪审计评价指标体系进行了深入研究,根据应急物资跟踪审计出现的问题提出恰当的改进意见,能在理论研究和完善相关制度方面有一定促进作用,以更好的实现国家治理。