胃癌组织中MicroRNA-200a的表达及靶基因预测

被引量 : 0次 | 上传用户:yuesulove
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:胃癌是源于胃粘膜上皮的恶性肿瘤,发病率及死亡率均很高。中国是胃癌高发的国家,发病率及死亡率均高于世界平均水平。虽然目前采取了包括手术、放疗、化疗及生物治疗等综合性治疗,但治疗的效果仍不十分理想,五年总生存低下。胃癌的发生有多种癌基因及抑癌基因的参与,揭示这些基因的变化规律,有助于阐明胃癌的发病机制,还能协助肿瘤的治疗及预后。随着近几年对胃癌研究的深入,人们逐渐意识到胃癌发生的机制比想象的更加复杂。微小RNA(microRNA,miRNA)是一类内源性的长约21-25nt的非编码单链RNA。研究发现,细胞的所有生物学过程几乎都有miRNA参与,包括细胞的发育、增殖、凋亡等。miRNA在肿瘤的发生发展中可能发挥着致癌或抑癌的作用。目前miRNA与肿瘤的关系逐渐受到重视,但其与胃癌的关系尚不明确。本研究通过Real-time PCR技术检测miRNA-200a在胃癌患者的癌组织及癌旁正常组织中的表达情况,探讨其表达情况与临床病理因素间的相关性。并利用生物信息学方法探索miRNA-200a的相关靶基因。从而为阐明miR-200a在胃癌发生及发展中的作用机制提供理论依据。方法:1收集2011年3月至6月于我院外科手术的,27例胃癌组织标本及癌旁正常组织标本。运用定量Real-time PCR方法检测miRNA-200a在胃癌组织及癌旁正常胃组织中的表达情况。采用配对t检验分析miRNA-200a的表达在胃癌组织癌旁组织中的差异。2收集标本的临床病理资料,包括性别、年龄、肿瘤大小、浸润深度、TNM分期、淋巴结转移、Borrmann分型和组织学分化程度等,然后采用单因素方差分析的统计学方法分析miRNA-200a在胃癌组织中的表达水平与胃癌临床病理特征间的相关性。3应用生物信息学软件PicTar、MiRanda和TargetScan对miRNA-200a的靶基因进行预测,筛选共同的靶基因。基于Gene Ontology数据库,对共同的靶基因进行GO分类,并对其进行显著性筛选,进一步缩小靶基因的范围。结果:1Real-time PCR技术检测27对胃癌及其癌旁正常组织miRNA-200a的相对表达量,结果显示22例(81%)miRNA-200a在癌组织中的表达水平显著低于癌旁正常组织,5例(29%)高于癌旁正常组织。在胃癌组织中相对表达量RQ值为0.33±0.01,对应癌旁正常组织为0.78±0.15,结果显示miRNA-200a在胃癌组织中表达显著下调,有统计学意义(P﹤0.05)。2miRNA-200a的表达水平与脉管瘤栓存在相关性(P﹤0.05)。与性别、年龄、肿瘤大小、浸润深度、TNM分期、淋巴结转移、Borrmann分型和组织学分化程度等各临床病理参数间均无显著相关性(P>0.05)。3运用生物信息学软件PicTar、MiRanda和TargetScan分析,预选出miRNA-200a靶基因的数目分别为430个、7645个和363个。发现交集靶基因共38个,包括KHDRBS2、GNB1、HMGB1、NOVA1、PAFAH1B1、PELI1等。基于Gene Ontology数据库,对共同的靶基因进行GO分类,并对其进行显著性筛选,提示部分靶基因参与信号的转导、蛋白质磷酸化、细胞增殖、迁移、凋亡等生物学过程。结论:1MiRNA-200a在胃癌组织中表达呈显著下调,显著低于癌旁正常组织中的表达。2MiRNA-200a的表达与脉管瘤栓存在相关性。提示miRNA-200a可能与胃癌的浸润、转移具有相关性。3通过生物信息学分析提示miRNA-200a结合并调控靶基因表达,参与信号的转导、蛋白质磷酸化、细胞增殖、迁移、凋亡等生物学过程。但还需进一步研究验证。
其他文献
近年来环境问题成为了民生关注的重要问题,尤其是大气污染越来越引起人们的重视。除了呼吁大家重视环境保护、治理已产生的环境问题之外,预防环境污染进一步恶化并提前检测治
本研究以西安市某所高中为例,主要聚焦于高中英语课堂教师纠错行为现状,以中介语理论和情感假设理论为理论基础,通过问卷调查,课堂观察和教师访谈的方式收集数据和资料,并进
随着我国经济不断发展,城市化进程不断加快,建筑施工开始迅猛增长,使得建筑幕墙、钢结构安装、建筑安装施工等行业进入高速发展时期,高处作业吊篮(简称吊篮)作为重要的高处作
目的:观察Carnation11®型光子治疗仪治疗混合痔术后疼痛、水肿及术创恢复延迟等并发症的疗效。方法:将120例痔术后患者随机分为治疗组与对照组各60例,治疗组以Carnation
随着科技的发展和中国加入WTO,中国与世界各国的贸易往来日益增加。药品与人们的生活息息相关,中国药品的出口在医药产业中有着重要的作用。为了扩大中国药品的海外市场,高质
农作物秸秆焚烧产生环境污染问题,已受到全社会的高度关注,秸秆还田是减少秸秆焚烧与资源化利用的重要途径,大量文献报道了秸秆还田可以改善土壤理化性状,增加土壤养分以及提
人民调解作为依靠民众自身力量解决矛盾纠纷的一种活动,是一项具有中国特色的法律制度,享有“东方经验”的美称。人民调解曾经在化解纠纷、协助政府化解社会矛盾、增进民众团
目的研究益气消瘢法对雌激素诱导子宫肌瘤模型豚鼠子宫组织细胞外信号调节激酶2(ex-tracellular signal regulated kinase2,MEK2)、磷酸化激活丝裂原激活蛋白激酶的激酶(phosphor
随着基础教育课程改革的不断深化,小组合作和深度学习受到越来越多教育工作者的关注,合作学习被普遍运用到初中课堂教学中,同时也产生了一系列的问题,比如教师花了很多精力设
目的总结不同病因的肝脏囊性病变的超声、CT和(或)MRI影像学征象,以提高肝脏囊性病变的诊断正确率。方法复习国内外关于不同类型肝脏囊性病变的影像学研究的文献,以病因为线