以深刻研究制度创新问题作为推进国家现代化治理的重要方向,并以此将国家治理能力与国家治理体系持续向现代化方向推进,是新时期提高政府行政效率的有效手段。在我国特有的社会和制度环境中进行制度创新,需要借鉴前人的经验和理论,同时又要结合我国自身特有的国情,通过理论和实践探索的有机结合,使制度创新具有高效性和可实践性,以此来构建创新创业型政府、开放透明型政府、治理能力高效的政府,以适应新时期新型政府构建的要求。本文以上海市自贸区单一窗口制度为研究对象,对单一窗口制度这一典型的制度创新案例在国际贸易中的作用进行研究,比较上海自贸区单一窗口制度与制度相对成熟地区单一窗口制度的不同现状和实践效果。基于创新扩散理论、信息不对称理论,分析总结了上海自贸区单一窗口制度目前仍存在的问题:即信息开放与信息安全存在矛盾,因此某种程度上的信息不对称现象对单一窗口制度的实施有其积极的意义;但决策各个环节过分的信息不对称现象在单一窗口制度的实施过程中,会导致政府部门上下级、不同部门以及决策主体与实施对象间对新政策的理解存在差异,进而导致决策失误和实施困难;同时如果没有好的顶层设计跟进,缺少统一标准,单一窗口制度创新也很难推广完善。文章根据以上几点提出非对称信息条件下单一窗口制度创新的对策建议:一是利用信息供求原理做好单一窗口制度的信息安全治理工作;二是在此基础上最大程度削弱单一窗口制度各环节的信息不对称程度;三是做好新制度的顶层设计,以确保单一窗口制度能够在统一的规范下运行;四是通过分析信息不对称现象对创新扩散理论五个阶段的影响,就如何促进单一窗口制度的传播推广做出详细阐述;五是利用奖励制度下的博弈理论和大数据等概念对单一窗口制度推广进行激励和检验。最后,文章总结了本文的主要结论和不足,并对本议题未来的研究方向进行了展望。