罗非鱼耐盐碱相关基因AQP1、mTOR克隆和表达特征分析

来源 :上海海洋大学 | 被引量 : 5次 | 上传用户:zhanggang406
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
罗非鱼是暖水性鱼类,隶属于鲈形目(Perciformes)、丽鱼科(Cichlidae)。罗非鱼生长快、养成周期短、易繁殖,是当前淡水养殖的重要养殖品种之一。盐碱是水体中影响鱼类渗透压平衡的重要因素之一,盐碱水通过高p H、高盐度、高碱度对鱼类造成器质性损伤,进而影响鱼类的渗透压平衡。水通道蛋白1(AQP1)和雷帕霉素靶蛋白(m TOR)是与鱼类渗透压调节相关的耐盐碱基因,本研究将以橙色莫桑比克罗非鱼(Oreochromis mossambicus)、荷那龙罗非鱼(O.hornorum)及其正交子代莫荷罗非鱼(O.mossambicus♀×O.hornorum♂,橙色莫桑比克罗非鱼♀×荷那龙罗非鱼♂)为实验材料,对其急性耐碱胁迫性能进行评估,克隆AQP1和m TOR基因并进行生物信息学分析,研究罗非鱼的鳃、肾、肠等组织中该基因在盐碱胁迫下的表达特征,从分子水平探索分析罗非鱼的耐盐碱差异,以期为日后研究罗非鱼的耐盐碱机制和开展鱼类抗逆育种提供参考。1橙色莫桑比克罗非鱼、荷那龙罗非鱼及莫荷罗非鱼急性耐碱胁迫能力的初步研究为评估三种罗非鱼的碱度(Na HCO3质量浓度)急性耐受性能,分别测定了橙色莫桑比克罗非鱼、荷那龙罗非鱼及其正交子代莫荷罗非鱼的96h半致死碱度浓度。急性耐碱胁迫实验表明,在p H为9.3-9.5条件下,橙色莫桑比克罗非鱼、荷那龙罗非鱼及莫荷罗非鱼的96h半致死碱度分别为3.99 g/L、6.67 g/L、4.96g/L。结果表明,荷那龙罗非鱼的急性耐碱胁迫性能最强,其正交子代莫荷罗非鱼的急性耐碱胁迫能力介于两亲本之间,莫桑比克罗非鱼的急性耐碱胁迫性能相对较差。2橙色莫桑比克罗非鱼AQP1基因和荷那龙罗非鱼m TOR基因的克隆与序列分析分别以橙色莫桑比克罗非鱼和荷那龙罗非鱼总RNA为模板,通过目的片段、5’和3’端序列的扩增、拼接得到AQP1和m TOR c DNA全长序列。其中莫桑比克罗非鱼AQP1 c DNA全长2612 bp,包含1760 bp的5’端非编码区、774 bp开放阅读框(ORF)和75 bp的3’端非编码区,共编码257个氨基酸,其DNA序列全长3215 bp,包含2个内含子,3个外显子;TMHMM 2.0在线软件分析表明橙色莫桑比克罗非鱼AQP1含有6个跨膜区,2个NPA结构单元和一个潜在的抑制细胞透水性的半胱氨酸残基结合位点TGCG。荷那龙m TOR c DNA序列全长8193bp,包含158bp的5’端非编码区、7551bp开放阅读框(ORF)和484 bp的3’端非编码区,共编码2515个氨基酸,含有300个(Asp+Glu)负电氨基酸残基和281个(Arg+Lys)正电氨基酸残基理论,等电点(Isoelecric point)为6.53。经过BLAST氨基酸序列比对,橙色莫桑比克罗非鱼AQP1和荷那龙罗非鱼m TOR基因分别与尼罗罗非鱼的同源性达99%;用MEGA 5.1构建NJ系统进化树显示,橙色莫桑比克罗非鱼AQP1和荷那龙罗非鱼m TOR基因都最先与尼罗罗非鱼聚为一支,再与鲈形目鱼类聚为一支。通过保守结构域的分析,AQP具有高保守特征序列NPA序列和两性分子通道;m TOR具有ATP结合位点(ATP binding site)、催化环(catalytic loop)、活化环(activation loop)和多肽结合位点(polypeptide binding site)等保守结构域。3盐碱胁迫下罗非鱼鳃、肾、肠组织中AQP1和m TOR基因的表达特征3.1基因AQP1在盐碱胁迫下的表达特征橙色莫桑比克罗非鱼、荷那龙罗非鱼及其正交子代莫荷罗非鱼和尼罗罗非鱼鳃组织中AQP1的表达量在淡水中比盐碱胁迫下的表达量要高且存在显著性差异(p<0.05);且四种罗非鱼肾中AQP1基因的表达量随着盐碱胁迫时间的延长有下降趋势且差异显著(p<0.05);由此可见AQP1基因的表达变化与环境中的盐碱胁迫有关。3.2基因m TOR在盐碱胁迫下的表达特征橙色莫桑比克罗非鱼、荷那龙罗非鱼、莫荷罗非鱼和尼罗罗非鱼鳃组织中m TOR的表达量在0h表达量较高,随着盐碱胁迫时间的延长m TOR的表达量呈下降趋势并趋于稳定;四种罗非鱼肾中m TOR表达量变化呈现先下降后上升又下降的趋势且差异显著(p<0.05);四种罗非鱼肠中m TOR的表达量整体呈下降趋势,且0h m TOR表达量与其他时间点存在显著差异(p<0.05);可以看出m TOR基因与四种罗非鱼的盐碱耐受性有关,参与渗透压调节。
其他文献
【摘要】21世纪是信息时代,科技技术改变了传统教育,以各类现代科学技术为基础的现代教学手段逐渐进入课堂。本文对中学数学现代化教学手段进行了系统梳理,进而提出现代教学手段应用中存在的误区,并给出合理的建议。  【关键词】中学数学  【中图分类号】G633.6【文献标识码】A 【文章编号】2095-3089(2015)01-0142-02  在西方发达国家,现代化教学手段在中学数学教学中已经得到普及,
期刊
自媒体自产生以来便迅速在青年群体中流行起来,在校女大学生也比较普遍地使用自媒体.把握自媒体运用的传播方式,了解女大学生这个群体的思想特点,充分利用自媒体进行针对女大
黄海中南部海域与长江口外邻近海域分别是黄海与东海的典型生态区。冷水团、暖流及径流等关键物理过程对这两个生态区的鱼类群落有重要影响。许多学者采用丰富度指数、多样性
学位
随着养殖技术的不断提高,水产养殖业逐渐向高密度、集约化、工厂化方向发展。影响集约化养殖的关键因素之一就是如何提高养殖水体中溶解氧的浓度,通过增加水中的溶解氧,可以提高
随着全球观赏鱼贸易市场的蓬勃发展,捕捞力度和压力的逐年增加以及生态环境栖息地的不断恶化,亚马逊河流域的盘丽鱼属鱼类(Symphysodon)野生资源因此遭受到了比较严重的破坏
【中图分类号】G623.5【文献标识码】A 【文章编号】2095-3089(2015)01-0143-01  生活离不开数学,数学也离不开生活。如果我们教师在教学中拉近数学与生活的距离,通过学生对生活中数学问题的观察和发现,引起学生的好奇心和求知欲,使学生体会到数学贴近他们的生活,从而对数学产生亲切感,激发起他们学习数学的热情和兴趣;通过引导学生对课堂中学习的数学知识进行实践运用,让学生感受到数学
日本鳗鲡(Anguilla japonica)是中国主要的鳗鲡养殖品种之一。在目前高密度集约化养殖过程中病害时有发生,反复使用抗生素等化学药物防治疾病导致耐药致病菌株的出现等一系列
【摘要】高考是学生学习生涯中最重要的一次考试,直接决定了学生未来的发展与成长。因此,不断提高学生的高考成绩是众多高中院校和教师不得不重视的问题。数学作为高考中的基础学科,其所占的分值较大,这就迫使高中数学教师重视高考数学复习工作。但是,在新课程理念下,高考数学的复习更加注重艺术性和技巧性。因此,本文对新课程理念下的高中数学复习进行研究,旨在提高高考数学复习的效率。  【关键词】新课程理念 高考 数
本文主要围绕中草药在凡纳滨对虾饲料中的应用展开研究,通过选择一些水产养殖上常用的中草药,添加到饲料中饲喂凡纳滨对虾,探讨不同中草药配伍对凡纳滨对虾生长和非特性免疫的影
【摘要】小学数学是开发学生思维能力的起始阶段,对学生后期数学大发展具有重要的作用。本文主要以小学数学教学中有效激发学生兴趣的作用为切入点,重点对有效激发学生兴趣的策略进行深入研究。  【关键词】小学数学教学 学生兴趣 策略  【中图分类号】G623.5【文献标识码】A 【文章编号】2095-3089(2015)01-0150-01  小学是学生学习的关键时期,培养小学生的学习兴趣是教学最关注的目标