随着全球观赏鱼贸易市场的蓬勃发展,捕捞力度和压力的逐年增加以及生态环境栖息地的不断恶化,亚马逊河流域的盘丽鱼属鱼类(Symphysodon)野生资源因此遭受到了比较严重的破坏。本文采用了分子生物学的手段首次对野生棕七彩神仙鱼和野生绿七彩神仙鱼的线粒体基因组全序列进行了分析,旨在探讨盘丽鱼属鱼类之间的系统发育进化关系,为该属鱼类的遗传进化提供更多的参考理论依据。具体研究内容如下:1.野生棕七彩神仙鱼和野生绿七彩神仙鱼线粒体基因组全序列测定采用第二代测序的方法,获得野生棕七彩神仙鱼和野生绿七彩神仙鱼的mtDNA全序列长度分别为16543bp和16545bp,其线粒体结构都包括13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因和1个D-loop非编码区。在碱基构成上,H链编码的12个蛋白质编码基因都表现出显著的反G偏倚现象。通过与已知的该属野生黑格尔七彩神仙鱼的线粒体基因组序列进行比对分析,3种野生种类的同源蛋白质编码基因起始密码子均相同:CO1编码蛋白基因以GTG为起始密码子,而其余的12个编码蛋白基因的起始密码子都是标准的ATG起始密码子;终止密码子却不尽相同,即完整的TAA和TAG、不完整的终止密码子TA-和T--。在22个tRNA中,除tRNA-Ser以外,其余21个tRNA都能形成三叶草结构。在非编码D-loop区,本实验识别了终止结合序列、中央保守区和保守序列区,经过序列的比对发现:非编码D-loop区序列是整个mtDNA中变异最大的区域,3种野生七彩神仙鱼序列非编码区长度差异不大,但是非编码区碱基变异很大。2.野生七彩神仙鱼遗传进化分析通过将3种野生七彩神仙鱼线粒体基因组的碱基相似度进行比对和分析,发现:编码蛋白质基因的碱基相似度为83.69%,rRNA基因的为93.68%,tRNA基因的为94.06%,D-loop非编码区的为87.96%,编码蛋白质基因的氨基酸之间的相似度为95.34%。以滑头鱼目黑头鱼科的两种鱼Alepocephalus agassizii和Bajacalifornia megalops作为外群,为37种鲈形目鱼类线粒体蛋白质编码基因构建了MP系统进化树,结果表明:慈鲷科(Cichlidae)、雀鲷科(Pomacentridae)和海鲫科(Embiotocidae)各自组成一个单系群;鲷科(Sparidae)和隆头鱼科(Labridae)亲缘关系最近;3种野生七彩神仙鱼聚为一支,其中棕七彩神仙鱼和黑格尔七彩神仙鱼距离最近。在线粒体D-loop区,通过分析TAS区碱基缺失和置换的情况,得出棕七彩神仙鱼和黑格尔七彩神仙鱼之间的差异最小,因此得出结论,棕七彩神仙鱼与黑格尔七彩神仙鱼的关系更近。