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随着RNA-seq技术的发展,环状RNA(circRNA)作为一种新式非编码RNA被推至公众视野下。circRNA是通过“头到尾”反向剪接从典型的剪接体中产生的,具有一定的组织和发育阶段特异性。迄今为止,circRNA的一些功能已经得到确认,它能够充当miRNA海绵以调控靶基因表达、参与调控转录过程、与自身mRNA的经典剪接相竞争、与蛋白质互作,并具有编码蛋白的潜能。家蚕是鳞翅目昆虫的典型代表,具有重要的农业和经济意义。家蚕质型多角体病毒(Bombyx mori cytoplasmic polyhedosis virus,BmCPV)能特异地感染家蚕的中肠上皮细胞,引发家蚕中肠型脓病,危害养蚕业。circRNA在调节真核生物的基因表达、调控生长发育和病理进程中发挥重要作用,但是关于家蚕circRNAs表达对BmCPV的感染应答及家蚕circRNAs的功能尚未可知。本研究采用高通测序法测定正常中肠组织(对照)和BmCPV感染的中肠组织(试验)中家蚕circRNAs的表达谱。从对照和试验样品中分别检测到了 9753和7475个circRNAs,其中共表达的circRNAs有6085个,在对照和试验样品中分别有646和737个circRNAs特异性表达。共检测到差异表达circRNAs3638个,其中400个circRNAs差异表达倍数变化≥2.0(p<0.05,FDR<0.05),病毒感染后294个上调,106个下调。通过GO和KEGG富集分析大体上注释了差异表达circRNAs亲本基因的主要功能。基于差异表达的circRNAs与microRNA(miRNA)结合位点之间的相关性分析,构建circRNA-miRNA相互作用网络,推断出了 13个miRNAs与 193 个 circRNAs 间的相互作用。bmo-miR-3389-5p,bmo-miR-745-3p 和bmo-miR-3262 分别与 30,34和 34 个 circRNAs 互作。circRNA8115,circRNA9444,circRNA4553,circRNA0827 和 circRNA6649 分别含有 6、5、4、4和4 个 miRNA结合位点。同时还发现circRN As选择性环化是家蚕的普遍特征,许多家蚕circRN As的junction位点傍侧序列符合典型的GT/AG剪接信号。家蚕 circRNA5655 序列长度为 563bp,由家蚕 histone-lysine N-methyltransferase eggless(LOC101742950)基因的第 9-13 外显子环化而成。RT-qPCR结果显示过表达circRNA5655后其亲本基因LOC101742950的转录水平显著降低,但Western blotting检测结果显示组蛋白甲基化水平却有所升高。细胞免疫荧光结果显示,circRNA5655在核、质中均有分布,而circRNA5655与家蚕NF90蛋白具有非序列依赖性共定位。通过circRNA-miRNA pull down和双荧光素报告系统证实,circRNA5655能够起到bmo-miR-3391-5p海绵作用,从而激活下游靶基因家蚕组蛋白去乙酸化酶Rpd3(Bombyx mori histone deacetylase Rpd3,XM004931383.2)和家蚕神经肽受体 A35(Bombyx mori neuropeptide receptor A35,NM001134279.1)的表达。通过RT-qPCR检测过表达circRNA5655细胞中凋亡相关基因的表达水平,发现过表达circRNA5655可导致家蚕p53样蛋白基因(Bombyx mori p53-likeprotein mRNA,KC243147.1)、家蚕信号转导和转录激活因子STAT基因(Bombyx mori signal transducer and activator of transcription,NM001163 916.1)、家蚕 survivin-1基因(Bombyx mori survivin-1,XM012688679.2)表达水平下调(p<0.05)。流式细胞术显示,过表达circRNA5655促进细胞增殖并抑制细胞凋亡。通过circRNA-proteinpull down和质谱鉴定发现,circRNA5655可能与线粒体硫胺素焦磷酸盐载体、琥珀酸脱氢酶组装因子2-B、动力蛋白β链等蛋白质相互作用。另外,我们还发现过表达circRNA5655对BmCPV增殖复制有抑制作用,但随着circRNA5655浓度的增加抑制减弱。生物信息学分析结果显示,circRNA5655具有m6A甲基化修饰位点(GGACC),并且包含一个跨circRNA5655反向剪接位点的开放阅读框ORF1,可能编码含有122个氨基酸残基的蛋白circR-P122。合成其特异性小肽RRNSVRTNASARSRFAC,并制备兔源多克隆抗血清,用Western Blotting可在家蚕中肠中检测到circR-P122蛋白的表达。BmN细胞和家蚕中肠组织的免疫荧光结果显示,circR-P122主要定位于细胞质中。Western blotting结果显示,过表达circR-P122蛋白后组蛋白甲基化水平有所抑制。