六个家鹅品种ND4基因序列进化与群体遗传结构分析

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本试验测定了在我国家鹅杂交育种中广泛应用的六个家鹅品种线粒体ND4基因的部分核苷酸序列(621bp),发现其平均GC含量为45.8%,偏倚不严重,在密码子的三个位点上,核苷酸组成的偏倚也不严重,但密码子的使用存在严重偏倚;序列间发生转换的碱基对明显大于发生颠换的碱基对(si/sv=3.8),转换主要发生在密码子第三位点上,颠换则全部发生在密码子第三位点上;同义替换速率(ds)和非同义替换速率(dn)分别为0.2633和0.0134,差异极显著,表明鹅线粒体ND4基因在进化过程中经历了净化选择的作用;共检测到了4种单倍型,4种单倍型的频率分别为0.467、0.0333、0.467、0.0333,单倍型多样性为0.582;各品种间的核苷酸分化系数(Nst)在0至1之间,家鹅群体的遗传分化主要是由灰雁家鹅与鸿雁家鹅品种间的遗传分化造成的;六个家鹅各品种内核苷酸多样性(Pi)很低,在0至0.01417之间,各品种间的遗传距离(D)很小,在0至0.02475之间,遗传相似度高(F:0.97525至1),而且同属于灰雁或鸿雁的家鹅品种之间的遗传相似度比分属于灰雁、鸿雁的家鹅品种之间的遗传相似度更高。
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