水稻抗稻瘟病性状的QTL定位分析

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水稻作为世界第二大粮食作物,稻瘟病严重影响着稻谷的产量和品质。在长期的生产实践中发现,培育广谱持久抗性的水稻品种,是目前防止稻瘟病大量爆发最经济有效的措施,而培育新品种之前,挖掘有效的抗稻瘟病基因是前提,对持续有效控制稻瘟病具有重要意义。地方稻抗源品种“地谷”对我国的稻瘟病菌表现广谱高度抗性,而“宁粳39号”是普遍感病的粳稻品种。本研究以“地谷”为母本,“宁粳39”为父本,构建F2分离群体,获得了 191个单株,利用105对在亲本间有多态性的SSR分子标记进行基因型分析,用MapChart进行遗传连锁图谱的构建,该图谱全长2920.08cM,平均27.81cM一个分子标记。同时,采用宁夏稻瘟病菌优势生理小种进行人工接种和自然诱发相结合的方法对水稻稻瘟病抗性进行鉴定,以病斑级别和综合抗病指数为指标,采用QTLIciMapping4.0软件对稻瘟病抗性性状进行QTL定位。主要研究结果如下:(1)双亲“地谷”和“宁粳39”的抗病性鉴定发现,叶瘟分别为1级和4级,综合抗病指数分别为0.25和7.25,两亲本间有明显差异。191份F3家系中,经过对叶瘟的抗性鉴定,其病级分布在1到8级。病级呈现连续性分布,其中,病级为3级和4级的居多,分别为63份和59份,没有达到最高病级的情况。多数家系的表型偏向抗病性亲本。综合抗病指数表明,F3家系分布在抗、中抗、中感、感这四个级别,没有高感和高抗的材料,其中抗和中抗材料分布较多,分别为73份和80份,大部分家系偏向抗病亲本,有一份材料表现出超亲抗病现象。(2)对F2分离群体进行病斑等级的QTL检测,共检测到12个QTL位点,分别位于2、4、5、6、10、12号染色体上,其中qtl2-1是贡献率最高的一个位点,它位于2号染色体标记RM525和RM475之间,LOD值为3.85,解释了 41.98%的表型变异,加性效应为-2.11;其次为qtl5-1位于5号染色体标记RM18378和RM592之间,LOD值为3.14,解释了 31.56%的表型变异,加性效应为-0.20,说明这两个QTL的增效基因来自于母本“地谷”。而qtl6-1和qtl12-1分别位于6号和12号染色体上,位于标记RM253和RM19810、RM27458和RM27433之间LOD值分别为3.11和2.98,分别解释了 31.12%和31.51%的表型变异,加性效应分别为0.12和0.12,说明这个QTL的增效基因来自于父本“宁粳39”。这些位点尚未见报道,为挖掘、克隆新的抗性基因提供了有利的基础。(3)对F2分离群体进行综合抗病评价的QTL检测时,共检测到1个QTL位点,qtl5位于5号染色体标记RM592和RM5592之间,LOD值为4.93,解释了21.05%的表型变异,加性效应为-1.85,说明这个QTL的增效基因来自于母本“地谷”。在病斑等级QTL检测时,在这个标记区间也检测到了一个位点qtl5-2,LOD值为2.74,解释了 13.63%的表型变异,加性效应为-1.27,也说明这个QTL的增效基因来自于母本“地谷”。这一结果说明被检测到的QTL具有一定的稳定性。
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