【摘 要】
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多趾是猪常见的一种遗传缺陷,其分子遗传学基础尚不清楚。对控制多趾的相关基因及其分子机制进行研究,有利于我们深入了解多指(趾)畸形的形成机制,揭示肢体发育的过程和机理。因此
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多趾是猪常见的一种遗传缺陷,其分子遗传学基础尚不清楚。对控制多趾的相关基因及其分子机制进行研究,有利于我们深入了解多指(趾)畸形的形成机制,揭示肢体发育的过程和机理。因此,本试验对控制猪多趾相关的基因进行初步定位和克隆,并探讨了造成猪多趾突变的原因,为阐明猪多趾产生的分子机制奠定了基础。1猪多趾基因的初步定位选取一个三代多趾猪家系(共38头,其中多趾10头,正常28头)作为研究对象,以人、鼠等动物已经定位的多趾基因的染色体区段为参考,通过比较基因组学,寻找猪的同源染色体区段并选择微卫星标记,应用聚合酶链式反应,变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染技术进行基因分型,采用LINKAGE 5.2软件包进行参数连锁分析。比较基因组学分析结果表明,猪的多趾相关基因位于9号染色体长臂(9q)和18号染色体上。在9q上选取6个(SW539、S0019、SW2093、SW174、SW2116、SWR1014)微卫星标记,在18号染色体上选取3个(SW1023、SW787、S0177)微卫星标记,对家系中的每一个个体进行基因分型。分型结果显示,微卫星标记SWR1014和SW1023在此家系中无多态性,均呈现纯合子基因型,而其它标记都显示出了良好的多态性。在常染色体显性遗传(AD)模式下,假设外显率为100%,重组率为0.0、0.1、0.2、0.3、0.4、0.5(公母猪重组率相等),疾病基因频率为10-4时,9号染色体上的位点SW2116在重组率为0.2时获得最大两点Lod值2.10,而其它位点的两点Lod值均小于1,这说明微卫星标记SW2116与猪的多趾基因可能存在连锁关系,而其它标记与疾病基因均不连锁。2猪Lmbr1基因的克隆在实际生产中,我们发现猪的多趾绝大多数为轴前多趾(PPD),但控制猪多趾基因的研究尚属空白。Lmbr1基因是人、小鼠、鸡PPD表型的候选基因,因此我们以一个多趾猪和它的一个全同胞正常个体为研究对象,根据人、小鼠和鸡的Lmbr1基因序列为基础,在Genebank中寻找猪的同源EST,据此设计引物,采用RACE、RT-PCR技术对猪的Lmbr1基因cDNA序列进行克隆、测序并进行突变分析。结果如下:(1)对于正常个体,共克隆出Lmbr1基因cDNA序列1795bp,包括3’端完整序列和5’端部分序列;多趾个体克隆出3’端序列1069bp。(2)将克隆出的正常个体的Lmbr1序列与人或鼠的C7orf2/Lmbr1相比较,CDS的5’端序列还有约330bp未克隆出,它与Genebank中发布的人C7orf2序列(登录号:NM022458,共2781bp,其中155bp-1627bp部分为CDS)的471bp-1627bp区段相比,同源性将近91%。(3)多趾个体和正常个体Lmbr1基因的CDS 3’端序列相比较,结果显示,多趾个体缺少16、17外显子共计231bp,但这是否为造成猪多趾突变的原因,还有待于进一步证实。
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