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以nα、nβ、nβαβ、n4β等五个二级结构参数为基础，用离散增量研究了蛋白质的聚类和蛋白质的结构型预测，α型，β型和αβ型可以很好地分别聚在三个大支中，蛋白质结构预测总体预测正确率为82%，用Self-consistency和Jake-knife这两种方法测试的结果没有明显的差别，从结果可以看出利用蛋白质的二级结构参数能较好地体现出各种结构型蛋白质的特点。