【摘 要】
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转录因子结合位点(Transcription factor binding site,TFBS)是与转录因子结合的DNA序列,它们与转录因子相互作用调控基因的转录过程。确定TFBS是理解转录调控机制,建立转录
【机 构】
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北京大学数学科学学院,军事医学科学院放射与辐射医学研究所,北京大学理论生物学中心
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(编号:30570425);国家重点基础研究发展计划项目(编号:2003CB715903);国家高技术研究发展计划项目(编号:2006AA02Z331,2008AA02Z306)资助
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转录因子结合位点(Transcription factor binding site,TFBS)是与转录因子结合的DNA序列,它们与转录因子相互作用调控基因的转录过程。确定TFBS是理解转录调控机制,建立转录调控网络的关键问题。随着高通量实验技术的发展,结合ChIP-chip实验以及多个基因组的序列信息来预测TFBS已成为新的研究热点。本文简要概述了用于TFBS定位的实验技术,TFBS信息相关的数据库,重点评述了描述TFBS的模型以及预测TFBS的多种软件。TFBS的生物信息学研究的发展,将与相关领域相互促进,有助于进一步揭示转录调控机制。
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