为进一步提高评估工作的透明度和公平性，2006年中国政府网站绩效评估工作面向社会公众广泛征集意见。《2006年中国政府网站绩效评估指标体系(征求意见稿)》发布后，社会反响热烈，收到大量宝贵的意见和建议。通过对这些意见和建议的分析和研究，我们对指标体系进行了修改完善，并在此正式发布。
　　
　　意见征集工作过程
　　
　　指标体系的意见征集工作分两个阶段进行：
　　征求意见阶段：8月1日~10月8日。中国电子信息产业发展研究院通过传真、电子邮件等多种方式向参评单位发送《征求意见函》，并通过各种媒体发布指标体系征求意见稿，宣传评估工作
　　反馈整理阶段：10月9日~10月25日。中国电子信息产业发展研究院对征集的意见和建议进行了分类整理，在认真地分析和研究这些意见后，对指标体系进行了修改完善，并形成最终的评估指标体系。
　　截至10月8日，共收到北京、上海、广州、湖南、江西、新疆建设兵团、广州、西安、监察部、科技部等409个单位的反馈。反馈主要通过电话和面谈的方式进行，共有366个单位采用了此类方式，占总数的89%。另有28个单位通过传真和邮件方式反馈意见，15个单位通过电子邮件的方式反馈意见。
　　
　　意见的统计和分析
　　
　　在收到的反馈意见中，大多数单位通过电话和面谈的方式，明确表示对评估工作和指标体系完全赞同，没有意见，包括：北京市、上海市、武汉市、司法部、国土资源部等352个地方和部委，占所有反馈单位的86%。这些单位对于《2006年中国政府网站指标体系(征集意见稿)》的科学性和合理性给予了总体上的肯定，认为指标体系设计思路是符合当前我国政府网站发展特点的。
　　另有湖南省、西安市、水利部、海关总署、人民银行等57个地方和部委提出了一些意见和建议。经过统计和分析，整理得到5类具有代表性的意见和建议：
　　1. 对工作方式方法的意见和建议；
　　2.具体指标设置的意见和建议；
　　3. 权重调整的意见和建议；
　　4.评分和排名时应考虑参评单位特点；
　　5. 咨询类的意见和建议。
　　根据各单位的意见和建议，我们对指标体系征集意见稿进行了下列修改，使指标体系更加完善：
　　1. 在“政务信息公开”方面，将“接受社会监督信息”中的“概况信息”指标说明中的“行业概况信息”改为“其他概况信息”(部委类)；将“接受社会监督信息”中的“概况信息”指标中的说明“新闻动态”调整到“工作动态”指标中；将“面向社会提供服务信息”中的“面向个人”指标中的“计划生育”改为“生育收养”(省级，地市级和县级)。
　　2. 在“在线办事”方面，将“表格下载”中的“面向个人”指标中的“计划生育”改为“生育收养”(省级，地市级和县级)。
　　3. 在“公众参与”方面，将“信箱类栏目”权重增加( 1)，“留言论坛类”权重降低(-1)。
　　4. 在“网站设计”方面，将“页面展示”中的“层级设置”指标的说明中“少于三次点击”改为“少于或等于三次点击”；在“页面展示”中增加“外文版”指标(部委类、省级)；“辅助功能”中的“定制功能”指标中的说明“电子刊物”改为“定制邮件”。