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福建的新石器时代考古始于20世纪30年代，厦门大学林惠祥教授调查建西部的史前遗址，并将调查结果写成《福建武平的石器》。第一次科学考古是1954年昙石山遗址的发掘，是由华东文物工作队和福建省文物管理委员会联合进行的，并将结果写成《闽侯昙石山遗址探掘报告》。福建新石器时代考古大致可以分为两个阶段。第一阶段是建国后到20世纪80年代以前。这阶段多是考古调查和小规模的发掘，而且发掘主要集中在闽江下游地区。第二阶段是20世纪80年代至今。