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棉蚜是第一个用RT—PCR方法发现具有2个不同乙酰胆碱酯酶（AChE）基因的昆虫，2个基因编码的氨基酸序列的相似性仅48％。进化分析表明，两者相距甚远，分化于昆虫纲出现以前。从棉蚜2个AChE中发现多个抗药性相关突变位点，但功能表达证实AChE-1可能是两类杀虫剂的主要作用靶标，AChE-1的S431F和A302S突变导致对多种有机磷和氨基甲酸酯类杀虫剂的敏感性降低，但对某些杀虫剂品种的敏感性反而升高。并讨论了需进一步研究的问题。