【摘 要】
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目的 利用DNA条形码技术探索喉红石斛Dendrobium christyanum的分类归属问题,并建立一种新的ITS2二级结构的信息挖掘方法.方法 提取分属5个组14种石斛的DNA,对ITS序列(ITS1-5.8 S-ITS2)进行PCR扩增,测序,获得ITS序列;基于序列信息,计算遗传距离、构建系统发育树,对ITS2的二级结构进行预测,并对其进行量化、聚类分析.结果 喉红石斛与黑毛组的矮石斛D.bellatulum、长距石斛D.longicornu的遗传距离最小,NJ系统发育树与ITS2二级结构的系统
【机 构】
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成都中医药大学西南特色中药资源国家重点实验室,四川成都611137;电子科技大学,四川省人民医院药学部(个体化药物治疗四川省重点实验室),四川成都611731;成都中医药大学西南特色中药资源国家重点实
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目的 利用DNA条形码技术探索喉红石斛Dendrobium christyanum的分类归属问题,并建立一种新的ITS2二级结构的信息挖掘方法.方法 提取分属5个组14种石斛的DNA,对ITS序列(ITS1-5.8 S-ITS2)进行PCR扩增,测序,获得ITS序列;基于序列信息,计算遗传距离、构建系统发育树,对ITS2的二级结构进行预测,并对其进行量化、聚类分析.结果 喉红石斛与黑毛组的矮石斛D.bellatulum、长距石斛D.longicornu的遗传距离最小,NJ系统发育树与ITS2二级结构的系统聚类图均显示喉红石斛与黑毛组石斛聚为一支,且喉红石斛与黑毛组石斛的二级结构图基本一致.结论 喉红石斛与黑毛组石斛的亲缘关系最近,应归属于黑毛组;新建立的ITS2二级结构量化分析方法可提供更多的分类信息,具有更高水平的分类潜能.这是首次运用DNA条形码进行石斛组间的分类研究,为石斛属植物系统提供了重要依据.
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