近年来因国家政策对国有企业混合所有制改革的不断推动,越来越多的国有企业走上了混改的道路,涉及的领域包括高速铁路、航空物流、基础电信、国防军工、医药卫生、石油石化等,混改路径有引入战略投资者、进行员工持股、整体或核心子公司上市、对外投资并购等。南京医药股份有限公司（简称“南京医药”）是我国医药流通类企业第一家上市公司,但随着多年的发展企业自身的一些问题逐渐暴露,以及受到国家医改政策的影响企业经营状况不佳,2010至2012年连续三年营业利润均为负数且存在企业内部控制失效等问题。南京医药为了走出经营困境更好应对医疗改革造成的利润空间压缩、竞争加剧的行业现状,2012-2018年先后进行了两次混合所有制改革。本文以南京医药2012-2018年间两次混合所有制改革为研究对象,主要采用案例分析法和对比分析法。运用案例分析法梳理南京医药混合所有制改革的背景、具体混改方案。结果显示南京医药进行混合所有制改革主要是因为企业经营陷入困境、内部治理存在缺陷、医疗改革压缩了企业的利润空间、企业不断发展带来的资金问题。选择的混改路径是引入战略投资者和进行员工持股。通过对比分析,包括南京医药过去十年财务比率纵向对比和将南京医药财务比率与行业均值之间横向对比来分析混合所有制改革对南京医药中长期财务绩效的影响。综合来看南京医药混改对企业偿债能力和盈利能力带来了积极的影响。企业长短期偿债能力较混合所有制改革之前均有明显的提高,盈利能力方面营业利润率、净资产收益率同样得到提高,逐渐接近并超过医药流通行业均值。但是混合所有制改革对南京医药营运能力和发展能力的提高较为有限,主要是因为受到医疗改革的影响,企业不得不以实行宽松的信用政策来维持客户扩大市场占有份额,以及因企业综合实力提升成为地区战略储备单位企业库存量加大。研究还发现南京医药混合所有制改革主要是通过补充流动资金、助力转换主营业务;引入非国有资本,调整股权结构;完善内部治理与监督机制;提高企业风险承担水平等来影响企业财务绩效。最后根据南京医药混合所有制改革对企业财务绩效的影响,以及在分析南京医药财务绩效过程中发现的问题提出建议,包括南京医药在发展过程中如何进一步提高财务绩效;医药流通行业整体营运能力有待提高;企业应重视管理层的日常经营;混合所有制改革或许可以成为行业内其他企业在竞争加剧的行业环境中站稳脚跟的方法等。