创新是企业发展的力量之源，是企业进步发展的重要的途径。而研发投入是企业作为创新过程的重要一环，是企业是否能在市场上取得优势的重要战略。因此创新在各界都受到了高度的重视。近年来我国企业对研发活动重要性的认识在逐步提高，企业研发投入明显增加，据初步统计，2015年我国企业研发经费逾1.1万亿元，年均增长11，9％;占全社会研发经费支出的比重为77.4％。企业研发人员约为425万人.因此要把科技创新作为一生产力，增加科技创新投入，让企业在整个行业中更具竞争力，是每个企业的使命。而作为众多企业中，中小上市企业面临着更多的机遇与挑战。中小企业在全国占比高达99％，因此中小企业在国民经济的发展中起到举足轻重的作用。而研发投入对中小型企业尤其重要，作为企业的重要的战略决策，能够激活中小企业的发展活力，在市场取得优势，区别于同质化的商品，只有差异化、优质产品才能有利于中小企业扭转在市场上的劣势地位。　　股权结构是研究终极控股股东行为动因，并导致经济后果的根本所在。在将创新作为发展战略的大环境下，企业的股权结构与研发投入之间的关系受到越来越多的关注。从中小板上市企业股权结构来看，绝大部分上市企业采取了金字塔式股权结构。即中小上市企业往往处于金字塔结构的最低端，从而导致所有权和现金流权分离，控制人通过不公平交易以少量资本获得公司的财富，影响企业的盈利水平。究竟这种结构对于企业的创新投入和产出是抑制还是支持呢？　　本文通过回顾国内外的研究文献，以委托代理理论、控制权私利、研发投入等作为理论基础，加以自己的理论分析，以2012年到2015年四年间的434家中小企业板上市公司为样本，以研发投入作为视角（中介变量），研究终极控制人行为通过影响研发投入，对企业绩效产生作用。　　本文以研发投入为中介变量，用终极控制人（控制权、现金流权、两权偏离度、控制层级）描述企业金字塔式股权结构，用ROA衡量公司绩效，探讨了研发投入、金字塔股权结构与公司绩效的关系。实证结果发现:(1)研发投入与公司绩效有显著正相关，研发投入越多，公司绩效也越高;(2)终极控制人的两权偏离、控制权、现金流权、控制层次对于企业的增长、研发投入有明显的负面影响，两权偏离度越大，企业增长状况越差、企业会减少研发投入;(3)研发投入在终极控制人特征与企业绩效之间起到中介作用。　　本文最后提出了对中小板上市企业和政府的建议，以及本文研究不足的地方和对未来研究方向的展望。