生物信息学是通过充分利用计算机结合生物学、信息学、数学、统计学等工具,对大量生物数据进行有效分析,最终获取有价值有意义的生物信息的研究领域。基于直系同源基因和多算法协同对物种的基因家族的研究一直是生物信息学的重点和热点,而根据转录组数据进行基因家族生物功能的预测同样是极其有效的分析手段。NF-Y基因是植物中的一种转录因子,在植物的生长过程和抗逆境过程中都扮演着重要的角色,而该基因在茶树中的存在形式以及拥有的生物功能并未被充分研究。基于此研究背景,本研究基于茶树的全基因组以及NF-Y直系同源基因运用多种算法的结合对茶树的NF-Y基因家族进行了多层次的研究分析,并对其生物学功能进行了有效的预测。本研究中,对茶树的基因组、全组织和多环境的转录组结合多种算法进行了 NF-Y基因家族的挖掘和鉴定,对茶树NF-Y基因家族结合多种算法的结合对其理化性质以及基因结构进行了多层次的分析。同时对茶树NF-Y基因家族的物种进化和分化时间进行了有效的分析,并根据直系同源基因所构建的进化树对茶树NF-Y基因的生物功能进行了可靠的预测。最后根据茶树多种状态下的转录组数据运用多算法协同进行了转录组数据分析,根据分析的结果对茶树NF-Y基因家族的生物功能进行了进一步的预测。主要研究结果如下:1.通过多种算法的结合,从茶树全基因组数据中得到了 NF-Y基因家族,其中NF-YA类基因有9条,NF-YB类基因有16条而NF-YC类基因有10条,同时研究还表明茶树NF-Y基因家族的序列具有较高的保守性。2.通过多算法协同对茶树NF-Y基因家族的理化性质和结构进行了分析,研究表明茶树NF-Y基因蛋白是亲水的脂溶性稳定蛋白,而且预测的三级结构有较高的可靠性。3.基于直系同源基因对茶树NF-Y基因家族分化时间及进化树进行了分析,发现茶树NF-Y基因的复制事件大概发生在3218万年前至390万年前之间,茶树和猕猴桃的分化被发现发生在4900万年至1300万年前之间。通过进化树我们预测茶树NF-YA2和NF-YA8基因参与茶树的抗旱过程以及NF-YB12、NF-YB14和NF-YC7参与促进茶树开花的过程。4.基于茶树转录组数据对茶树NF-Y基因家族的生物功能进行了预测,我们能够预测茶树NF-Y基因家族中NF-YA6等四条基因在茶树抗寒冷逆境中生长起着有效作用,而NF-YA5、NF-YA7等七条基因在茶树处于干旱逆境中参与了其抗旱调控机制。