利用CRISPR/Cas9技术对水稻OsYUCCA成员进行基因编辑的研究

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CRISPR/Cas系统为细菌与古生菌用于抵御外源病毒或质粒DNA入侵的获得性免疫系统。该系统在cr RNA的指导下,使核酸酶Cas识别并降解外源DNA。其中Ⅱ型CRISPR/Cas系统最为简单,仅包括一个核酸酶Cas9与tracr RNA:cr RNA二聚体便可实现其生物功能。CRISPR相关蛋白Cas9是一个核酸酶,其使用RNA双链指导序列tracr RNA:cr RNA与DNA靶序列形成碱基配对,对外源DNA双链进行切割,实现基因组的定向编辑。 植物体中生长素主要以吲哚-3-乙酸(IAA)的形式存在,在植物生长和发育的过程中发挥关键作用,但水稻中关于生长素生物合成的调节机制尚不清楚。水稻中YUCCA基因家族有14个同源基因。为研究生长素生物合成在模式作物水稻(Oryza sativa)生长发育中的功能,我们利用CRISPR-Cas9基因编辑技术,对Os YUCCA基因家族14个基因进行敲除实验。每个基因设计两个靶点序列,共构建针对水稻14个Os YUCCA基因的28个敲除载体。通过基因序列分析,将合成正确的靶点序列插入含hsp Cas9n的载体中,再与p CAMBIA1300重组,构建基因编辑载体,通过农杆菌介导的方法转化水稻粳稻品种9522愈伤,共获得519棵转基因苗。通过序列分析从这519棵转基因苗中鉴定得到Os YUCCA1和Os YUCCA3两个基因的突变体,osyucca1的突变类型为靶位点1在其外显子第260号碱基处插入碱基A或T两种类型纯合突变,靶位点2在其外显子第447号碱基处插入A、444号碱基C被T替换、445号碱基G被C替换的杂合突变;osyucca3的突变类型为靶位点1在其外显子第494号碱基处插入T的纯合突变;并对osyucca1突变体的表型进行了初步观察和分析,发现osyucca1和osyucca3的突变株系都存在移码现象而使其翻译的氨基酸提前终止致使基因突变。本研究成功利用CRISPR-Cas9基因成功编辑技术敲除了水稻Os YUCCA1和Os YUCCA3基因,为进一步研究Os YUCCA基因家族功能提供了基础。
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