改革开放以来,我国经济实现了快速发展,但这种高投入、高消耗、高污染的粗放型经济增长模式带来了许多环境问题。这些环境污染问题不仅对国民福利产生影响,同时制约了经济可持续发展。因此,如何处理经济与资源环境之间的矛盾,是我国当下重点问题之一。创新是发展第一动力,在环境因素约束下,绿色技术创新被认为是协调创新与绿色发展的重要手段之一。然而,绿色技术创新同时具有技术外溢性和环境效益的“双重外部性”,因而需要政府发挥职能矫正市场失灵问题。从以往研究来看,对环境污染行为具有调节作用的绿色税收和政府研发补贴作为国家宏观调控的重要政策工具,是否能有效激励区域内绿色技术创新活动,学者们意见不一。绿色技术创新行为会历经技术研发和成果转化两个阶段,不同地区不同阶段的绿色技术创新效率均存在差异,因此,本文从政府政策这一视角出发,探究绿色税收、政府研发补贴对不同地区绿色技术创新两阶段效率的影响,为地方政府政策制定及实施提供参考意见。本文使用我国2009-2015年30个省级地区（西藏地区除外）的面板数据,将30个省份划分为东中西部三大地区,比较绿色税收、政府研发补贴对我国整体及东中西部地区绿色技术创新不同阶段效率的作用效果差异。首先,本文对国内外相关文献进行梳理归纳,对主要的研究观点和结论进行整理;其次,对本文核心变量概念进行界定,并在相关理论基础上提出研究假设;再次,利用熵值法测算出我国30个省市2009-2015年的环境污染综合指数,在传统技术创新效率测算指标体系中,加入该指数作为非期望产出,将各省市绿色专利申请量作为中间产出,通过可变规模情形下两阶段关联型网络DEA模型求出各省市绿色技术创新整体及两阶段效率,比较各区域不同阶段绿色技术创新效率之间的差异;最后,构建面板数据模型,探究两种政策的影响效果。通过本文的研究发现:第一,绿色税收与政府研发补贴对绿色技术创新效率影响方向一样,均为先抑制后促进作用,但绿色技术创新活动对绿色税收政策反应更为剧烈;第二,地区异质性的存在,使得绿色税收、政府研发补贴对各地区的绿色技术创新两阶段效率影响效果存在差异,因此政策实施须有针对性。最后,本文基于研究结论提出构建绿色税收体系、完善政府补贴政策、加强区域间技术资源流动等政策建议,并且指出了本研究存在的不足之处。