氟胺氰菊酯对意大利蜜蜂脑组织microRNA表达谱影响分析

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意大利蜜蜂是我国主要饲养的蜂种,对维持生态系统平衡和生态环境可持续发展具有不可或缺的作用。但相对于其他蜂种,意大利蜜蜂的抗螨能力较弱。而自本世纪以来,蜂螨危害蜂群的现象越来越普遍,而且范围也越来越广,给养蜂业的发展带来了前所未有的挑战。目前常用杀螨剂的主要成分为氟胺氰菊酯,氟胺氰菊酯是一种使用广泛且相对安全的蜜蜂杀螨剂。在实际生产中,应用氟胺氰菊酯类药物除螨后蜂群出现数量减少,行为异常等现象,给养蜂业造成了很大损失,目前对该现象的产生机制了解仍较少。microRNA作为一种非编码的小RNA,能够参与转录后水平的各类生物学调控过程,在生物体内参与诸多生物学功能。本试验随机选取6群群势相近的意大利蜜蜂继箱群,其中3群为空白对照组,3群为试验组,每组三个重复,每个处理20只蜂。试验组选用氟胺氰菊酯条进行投药,在用药后的第10天、20天和30天分别进行取样,共取240只蜂样。解剖脑组织后进行miRNA测序,分析使用氟胺氰菊酯后随着时间变化意蜂脑组织中差异表达的microRNA及其潜在的靶基因,为揭示差异表达miRNA在氟胺氰菊酯胁迫应答中的作用。研究结果如下:1.通过测序,12个文库总共获得184051902条clean reads,过滤数据后,最终得到的s RNA clean tags序列最多为18109705条,最少为9626768条,分布范围在94%~98%。各个样本文库reads数差异在合理范围,没有异常样品,测序质量良好。2.经注释,共鉴定出1069个miRNA在12个文库蜜蜂脑组织中表达;氟胺氰菊酯胁迫处理的样本和对照组中筛选出差异表达的miRNA(FDR<0.05和|log2(FC)|>1)为15个,其中包括两个新发现的miRNA(novel-m0194-5p,novel-m0184-5p)。在这些差异表达的miRNA中,CK-vs-X1D10的上调差异表达最多,共有6个;CK-vs-X1D20的下调差异表达最多,为7个。3.表达模式聚类分析表明,差异的miRNA呈现出3种表达模式(C1、C2、C3)。其中占差异miRNA总数过半的C1簇和C2簇在用药后普遍呈现高表达,在第10d出现峰值,并且随着用药时间的增加,表达量逐渐下降至用药前水平;且主要富集在各类代谢相关通路,表明C1和C2簇的miRNA参与的转录水平调控可能与应激反应有关;占差异miRNA总数近半C3簇经过药物处理后,miRNA的表达量逐步出现下降,到20d后趋于正常,且主要富集在功能通路,表明这些差异miRNA参与的转录水平调控可能与应答过程有关。4.GO富集分析中,生物过程主要富集在细胞蛋白修饰过程生物调节、m RNA的代谢过程等条目;细胞组分主要分布在细胞和细胞器条目;分子功能主要分布在结合和细胞蛋白修饰过程条目等。KEGG富集结果显示,差异miRNA对应靶基因显著富集到四条KEGG通路,分别为Dorso-ventral axis formation通路,Phototransduction-fly通路,Hippo signaling pathway-fly通路和Wnt signaling pathway通路。这些显著富集通路及差异的miRNA可能与大脑中海马区细胞凋亡、记忆损伤等有关。氟胺氰菊酯用药后的意蜂异常活动原因可能是药源性大脑损伤导致的神经机能紊乱、兴奋过度、记忆缺失。
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