目前,农民工群体已经成为我国经济发展中具有重要作用的一个群体,受到来自各个方面的越来越多的关注。如何具体引导这个群体健康发展,使其继续为我国经济发展做出其特有的贡献；如何维护其权益,促进社会与人协调发展,日益成为众多学者研究的社会焦点问题。其中,农民工的医疗保险问题已是当前政府必须解决的重要课题之一。本文以卫生服务公平性相关理论为依据,回顾了全国和嘉兴新型农村合作医疗保险制度的实践,分析了农民工非稳态转移的特点、卫生服务的需求及新农合对农民工的优势,对全国各主要城市农民工医疗保险模式进行了比较,特别是对嘉兴允许一定条件的农民工参加合作医疗保险政策进行分析和研究,指出了政策进一步完善的对策。本文通过对289名各行业的农民工和56名企业主的调查分析,了解农民工对医疗保障政策的知晓程度、参加居住地新农合的意愿及企业主对农民工医疗保障制度的财力投入情况,为实现农民工居住地参加新农合提供了第一手资料。针对在实现农民工居住地参加新农合中面临的问题,本文从卫生服务公平性方面,提出了政策建议。通过中央财政支付转移、加快合作医疗信息化建设、新农合由卫生部门管理向社保机构管理转型等措施来实现农民工参加居住地新型农村合作医疗保险的意愿。