近代科学的重大发现和重大问题的解决常常需要涉及多个学科的相互交流与融合。交叉科学研究在推动、促进传统学科发展的同时,已经成为当代科学发展的时代特征和提高科技创新能力的重要途径。如何对交叉科学这一复杂的概念进行有效的、可操作的量化测度,如何对交叉科学研究成果进行有效的鉴定与评估,已成为科技政策制定与科技管理部门关注的重要前沿问题。本研究创新性地提出了基于合作者机构信息的交叉科学测度方法,并将其与传统的基于参考文献的交叉科学测度结果进行了对比。进一步将新兴的使用数据与引用数据相结合,对交叉科学研究成果进行了较为全面的影响力研究,以期为相关部门的项目评审、管理评估、成果鉴定等提供参考与借鉴。本研究主要由以下四个部分组成:首先,以Web of Science学科分类体系为依据,提出了适用于机构信息的学科分类方案,并基于Derwent Data Analyzer软件的词表功能构建学科特征词表,完成对作者机构的学科划分;其次,通过对现有学科交叉测度指标的梳理,构建了基于合作机构信息的交叉科学测度指标体系,并在单篇论文的基础上实现了学科交叉程度的测度;再次,将基于合作机构的交叉科学测度结果与传统的参考文献测度结果进行了对比,在此基础上构建了合作机构与参考文献双重视角下的学科测度关系模型,并借助科学知识图谱更加直观地展示了合作机构与参考文献的学科交叉情况;最后,在传统引文指标的基础上,引入PLoS官方平台的使用数据(html浏览量、pdf下载量及xml下载量)作为补充,综合反映多学科机构合作对研究成果影响力的作用。研究结果显示,合作机构与参考文献不同视角的学科交叉测度揭示了交叉科学这一复杂概念的多维特征;多学科机构合作对研究成果的使用数据与引用数据均有一定的积极作用,即学科交叉程度高的一组论文,对应有更多的使用与引用数据。相对于引用数据,在论文发表初期(1-2年),使用数据可以更为快速地反映出学科交叉特征与论文影响力之间的关系。通过实证和对比研究,本文不仅为交叉科学研究成果的测度提供了新的研究思路和方法,同时也为学科交叉的管理机制和相关科技评价政策的制定提供了有益参考。