【摘 要】
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Ridgeia piscesae是热液口管状蠕虫的一种,主要分布于东北太平洋Explorer、Juan de Fuca及Gorda洋中脊。该类管状蠕虫具有形态多样性,按其形态主要可分为短胖型及细长型虫体
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Ridgeia piscesae是热液口管状蠕虫的一种,主要分布于东北太平洋Explorer、Juan de Fuca及Gorda洋中脊。该类管状蠕虫具有形态多样性,按其形态主要可分为短胖型及细长型虫体。根据以往研究,管状蠕虫R. piscesae滋养体中的共生微生物类型被认为主要为γ-proteobacteria,但是也有很多研究报道反对这种“滋养体单一菌种”的假说。本论文的主要目的是鉴定由深海热液口Juan de Fuca洋中脊Endeavor段采集的管状蠕虫R. piscesae的共生微生物类型,并进行相关代谢机制研究。实验中,我们运用差速离心的方法分离了该管状蠕虫共生微生物,并通过通用引物对该共生微生物的16S rDNA进行了扩增,建立了16S rDNA克隆文库并对该文库进行了限制性酶切片断多态性(RFLP)分析。RFLP分析及后续测序显示,该管状蠕虫共生微生物只包含一种类型的微生物,即ε-proteobacteria,与以往发现的共生微生物类型完全不同。为了鉴定该共生微生物的自养特性,我们通过PCR扩增了其固碳途径的关键酶D-ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase (RuBisCO)基因。我们发现该共生微生物同时含有两种形式的RuBisCO基因(cbbL和cbbM),反应了其利用卡尔文循环固定无机碳的自养途径;另一方面,通过对硫氧化相关基因的筛选,我们证明该共生微生物自养代谢的能量来源于对环境中无机硫的氧化过程。此外,为了便于活性物质基因簇的挖掘,我们建立了该管状蠕虫共生微生物大片断基因组DNA的cosmid文库并对文库中重金属抑制酶的克隆进行了筛选。通过对获得的抑制砷、铅及铜离子的活性克隆进行交叉检测后,砷抑制克隆表现较高抑制活性。因此,我们将该克隆进行了cosmid质粒测序。根据测序结果,我们鉴定了砷抑制酶的基因簇以待后续功能检测工作的进行。
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