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帘蛤科是我国沿海的经济贝类之一,广泛分布于我国海岸线及河口地区。近年来海洋污染的加剧、过度的捕捞及栖息地的破坏,使得其资源量呈下降趋势。帘蛤科贝类在我国海洋经济中占有重要地位。目前,已开展养殖的有文蛤（Meretrix meretrix）、青蛤（Cyclina sinensis）等12个种。此外,还有很多种类具有潜在的开发价值。目前,国内对帘蛤科的研究主要集中在育苗和养殖技术方面,基础研究还相对滞后。本研究主要采用线粒体DNA标记对我国沿海帘蛤科中三种贝类斧文蛤（Meretrix lamarckii）,文蛤（Meretrix meretrix）及等边浅蛤（Gomphina aequilatera）的群体的遗传多样性进行分析。研究结果如下:1.本研究从138个斧文蛤中获得了片段长582bp的COI基因序列,检测出15个多态性位点和28个单倍型,从125个个体中获得片段长为1168bp的Cytb基因序列,包含18个多态位点和22个单倍型。COI的单体型多样性和核苷酸多样性分别为0.733±0.035和0.00304±0.00023,Cytb的单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.789±0.036和0.00211±0.00018。FST结果显示舟山（ZS）和象山（XS）群体分别与温州（WZ）,漳浦（ZP）,汕头（ST）和湛江（ZJ）群体之间有显着的遗传差异（P<0.01）(除基于两个基因的的XS群体与ZJ群体之间的FST,和基于Cytb的XS群体与WZ群体之间的FST,（P>0.01）)。这与单倍型网络图、UPGMA系统进化树以及STRUCTURE聚类图结构一致。分子方差分析结果表明,81.81%（COI）和80.90%（Cytb）的变异来自群体内群体内（P<0.05）。因此,中国海域斧文蛤具有明显的遗传差异。2.本研究从122个文蛤中获得片段长为672bp的COI基因序列,共检测出33个单倍型;从134个个体中获得片段长为685bp长的Cytb基因片段,共检测出33个单倍型。COI的单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.968和0.01697,Cytb基因的单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.959和0.01288。FST结果表明青岛（QD）、盐城（YC）和南通（NT）群体与漳州（ZZ）、珠海（ZH）、北海（BH）和海口（HK）群体发生了显著地遗传分化（P<0.05）。这和NJ系统发育树、单倍型网络图及STRUCTURE聚类图结果一致。分子方差分析结果显示,93.12%（COI）和90.91%（Cytb）的变异来自群体内群体内（P<0.05）。3.从77个等边浅蛤个体中获得的685 bp的COI基因序列并进行测序,共检测到37个多态性位点和33个单倍型。对81个样品中中获得的对350bp片段的12S rRNA基因的进行测序,并检测到4个多态性位点和7个单倍型。COI基因的单倍型多样性处于较高水平,而12S rRNA检测的单倍型多样性处于中等水平。在COI基因中显示出较为显著地FST值,其中ZS和BH群体之间的尤为显著(FST=0.444);在12S rRNA中同样显示出相同的结果。单倍型网络图表明舟山和北海群体之间存在明显的遗传分化,这与FST分析结果一致。分子方差分析结果显示群体内部和群体间都有很显著地遗传差异。我们的实验结果表明三个帘蛤科贝类均发生了明显的遗传分化。