识别膀胱癌糖基因亚型并评估ST3GAL6的标志物功能

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膀胱癌是世界上恶性浸润和高转移为特征并且能导致病人死亡的恶性肿瘤之一,目前对其分子分型标志物和分子机制调控的了解仍然不多。异常糖基化在肿瘤发生发展过程中有着重要的调控作用。譬如,在信号通路,肿瘤细胞分裂及浸润,细胞基质连接,血管生成,转移和免疫调控过程中扮演着重要作用的靶分子常常存在糖基化修饰的改变。因此,异常糖基化修饰被看作是重要的肿瘤标志之一。鉴于现有糖基化肿瘤标志物属性不是很明确,所以需要进一步解析糖基化作为肿瘤标志的重要功能。唾液酸化是一种糖基化生物修饰类型,由唾液酸转移酶把唾液酸基团添加到特异靶向底物蛋白质或者脂质末端的合成过程。该可逆的过程可以由唾液酸酶反向移去唾液酸基团从而去除唾液酸化修饰。细胞表面糖蛋白或糖脂的唾液酸化在胚胎细胞发育、肿瘤转化、免疫应答等生物学过程中发挥着重要作用。在临床上,血清中总的唾液酸水平和诸如唾液酸化修饰的前列腺特异性抗原、路易斯A(SLe A;又名CA19-9)和路易斯X(SLe X)等一些唾液酸化蛋白常被作为临床肿瘤诊断标志物。此外,这些成分和酶的改变也会参与疾病发生发展过程。为了确定糖基转移酶的表达是否可作为膀胱癌的分子分型的标志物,我们利用无监督式等级聚类分析方法在膀胱癌公共数据库185个糖基转移酶基因的表达谱中系统分析了病人的生存情况和临床病理参数。用R语言线性模型识别出的糖基化基因的性质与基因组变异分析得出的8个已知膀胱癌分子特性存在相关性。分析得出的糖基转移酶基因与临床数据相关性和功能分析由病人样品中的免疫组化、膀胱癌细胞系的定量PCR、蛋白质印记、启动子活性分析、MALII凝集素杂交、免疫荧光染色、划痕实验、细胞迁移实验等检测,结果辨别出一组包含ST3GAL6在内的14个糖基转移酶基因特征组成的膀胱癌亚型。糖基转移酶ST3GAL6能转移唾液酸至半乳糖残基的羧基上,展示了与膀胱癌(n=2130)中的腔型亚型有显著的负相关性。表达上升的ST3GAL6与公共数据库以及我们自己收集的52例膀胱病人样品的肿瘤阶段、级别、生存恶性成正相关性关系。转录因子GATA3是一个重要的膀胱癌腔型亚型的标志物,我们检测到GATA3能够直接负调控ST3GAL6的转录表达。在5637和J82两株膀胱癌细胞中敲降ST3GAL6基因能降低MALII水平、肿瘤细胞浸润和迁移。在膀胱癌的SW780细胞中,过表达的ST3GAL6能够挽救GATA3敲降而导致的总体唾液酸化水平和癌细胞的体外侵袭能力。综上所述,我们成功提出由14个糖基转移酶基因组成的不良预后的膀胱癌亚型,并鉴定了该组合中重要的糖基转移酶ST3GAL6受腔型转录因子GATA3负调控的促癌细胞侵袭因子以及潜在生物标记物特征。
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