长链非编码RNA CR43282-CR46040调节果蝇肠道干细胞增殖

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组织内稳态是一个动态的过程,需要新细胞的产生来补充那些衰老和损伤的细胞,保持良好平衡。肠道作为新陈代谢最快的组织之一,当肠道损伤时,肠道干细胞可以通过持续增殖来补充受损的上皮细胞,因此肠道干细胞在维持肠道稳态、肠道屏障功能方面的作用至关重要。果蝇消化道上皮是单层的,其在形态上分化为不同区域。其中中肠是最具代表性的,包含基于不同形态和组织学特性的亚区以及基因表达谱。多能肠干细胞(ISCs)显示中后肠(PMG)的增殖率较高,表达Notch配体Delta,并持续产生EBs。尽管ISCs和EBs都表达转录因子escargot(esg),但EB中的Notch受体激活导致抑制Su(H)的活化并分化成ECs,表达POU结构域的转录因子Pdm1。重要的是,一部分Su(H)+EB分化成表达Prospero的肠内分泌细胞(EE)。在生理和应激条件下,ISC分裂和分化受到JNK,Egfr/Ras/MAPK,Notch,Wnt,JAK-STAT和m TOR等几种途径的控制。m TOR通路是一个著名的自噬调控器。果蝇的肠道结构及细胞组成与哺乳动物的肠道非常相似,果蝇的前胃前肠相当于哺乳动物的胃,用于贮存食物;果蝇的中肠相当于哺乳动物的小肠,消化食物吸收营养物质,果蝇的后肠相当于哺乳动物的大肠,用于排泄。哺乳动物的肠道干细胞在肠绒毛隐窝处,靠近基底膜,由隐窝向肠腔纵向进行分裂分化,ISC分裂产生中间过渡细胞(TA cell),随后分化EC,EE及潘氏细胞,靠近肠腔有一层粘膜;果蝇肠道表皮细胞组成与其相似,肠道干细胞也靠近基底膜,分裂产生EB细胞,进而分化为肠道上皮细胞(EC),具有毛刷状边缘及多倍体核,吸收营养物质,肠内分泌细胞(EE),分泌激素,外层是围食膜,粘膜。正因为果蝇与哺乳动物肠道结构组成的相似性及遗传学优势,果蝇肠道干细胞已经成为研究肠道干细胞的经典模型。近年来,人们发现lnc RNA在调控细胞正常发育和疾病发展过程中起着非常重要的调节剂的作用。它们参与组织和细胞特异性的表达模式,并潜在参与诸如细胞命运和分化等生物学过程。lnc RNA的作用通常在核中,在转录反应和调节染色质的结构和功能等过程中至关重要。目前,据我们所知,尚无参与果蝇ISC特异调控且必不可少的lnc RNA的相关报道。所以我们想知道lnc RNA是否也参与果蝇肠道干细胞增殖与分化的调控。我们通过DSS喂养果蝇后筛选发现CR43282-CR46040KO果蝇中肠道干细胞的数目与对照相比明显减少,表明在果蝇肠道损伤应激的条件下,CR43282-CR46040影响肠道干细胞的增殖。之后我们通过PH3抗体染色发现CR43282-CR46040敲除果蝇株ISC/EB细胞数目的减少是由于ISC的增殖减少造成的,表明肠道再生时CR43282-CR46040参与ISCs的增殖过程。同时我们利用互补实验证实了正是因为CR43282-CR46040的缺失才导致了这一现象。我们通过MARCM克隆实验再次证实了CR43282-CR46040参与损伤后ISCs的增殖过程。接下来我们检测了损伤条件下相关通路的激活情况,我们发现CR43282-CR46040的缺失导致JAK-STAT通路激活明显减弱。有趣的是我们研究发现CR43282-CR46040并不参与ISCs的分化过程。lnc RNA对肠道干细胞功能的调控还未有过报道,本研究为进一步揭示lnc RNA对肠道干细胞增殖与分化的调控机理提供了帮助。
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