义务教育的基础性、先导性、全局性特征决定了它在教育事业中的根本地位。但是,长久以来受制于我国经济和社会发展阶段的具体国情,义务教育特别是农村义务教育未被置于财政重点保障的位置,成为整个教育体系发展最薄弱的环节。伴随着我国教育改革的整体深入,义务教育经费保障新机制带来了农村义务教育巨大改变。但是,对于义务教育的薄弱环节初中教育而言,依然面临办学条件落后、教师队伍建设问题严峻、教育质量不高、学生发展问题突出等发展困境。通过分析,可以得出造成农村初中教育发展困境的主要因素有：农村初中教育长期未受重视、缺少整体性发展规划、没有考虑新的教育需求以及各级政府在农村初中管理和经费保障中的责任不明。而完善农村初中教育经费保障体系,必须结合整个国家经济结构调整、公共管理变革、城乡统筹发展的时代背景,借鉴国内外义务教育经费保障的成功经验,依据系统分析思路,改革、完善以及创新现有管理和保障体系。因此,在新的历史时期,农村初中教育经费保障体系的建构,可以依照以下的路径进行：科学规划农村初中发展；明确各级政府在农村初中教育管理和教育经费保障中的责任;建立和完善中央、省、县三级农村义务教育财政监测与评价体系以及学校预算管理制度；逐步实施农村初中教育财政充足性保障和初中学生资助制度;创新农村初中教育经费保障体系。