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根据已发表的猪瘟病毒（Classical Swine Fever Virus，CSFV）Shimen株、HCLV株和Paderborn株的全基因组序列，设计并合成11对引物，应用RT-PCR技术，成功地分11个片段扩增了CSFV广西流行毒株GXWZ02的全基因组，并将这11个基因片段克隆到pGEM-T和PMD18-T载体上，测定其核苷酸序列。应用计算机生物软件Vector NTI Suite 6将11个基因片段进行拼接，确认CSFV GXWZ02株全基因组序列的长度为12296个核苷酸。将CSFV GXWZ02株与国内外已发表的Shimen、HCLV、39、Brescia、Eystrup、Glentorf、Alfort187、Paderborn、CS、ALD、GPE-、P97、LPC毒株进行全基因组序列和推定的氨基酸序列比较，结果显示，核苷酸同源性分别为85.4％、84.6％、88.7％、85.7％、85.7％、85.3％、85.6％、95.3％、85.7％、85.7％、85.4％、83.4％、84.3％，推定的氨基酸序列同源性分别为92.6％、91.7％、94.2％、93.1％、92.9％92.3％、93.0％、97.7％、92.6％、93.0％、92.6％、90.5％、90.6％。GXWZ02与Shimen、HCLV的全基因组序列及推定的氨基酸序列同源性有明显变异，表明GXWZ02与Shimen、HCLV在遗传性和抗原性上存在较大差异。系统发育树分析表明，所比较的14株CSFV被分为两个群，GXWZ02、Paderborn和39这3个毒株被归为群Ⅰ，其余的11个毒株被归为群Ⅱ，GXWZ02与Paderborn的亲缘关系最接近。将GXWZ02与Shimen、HCLV基因组中单个基因分别进行核苷酸及推定的氨基酸序列同源性比较，结果显示，基因NS5A、E2、NS2、Erns的遗传变异程度大，而NS3、NS4A、NS4B的遗传性则相对保守。