目的比较乳腺原发癌随访3年有远处转移病例与无远处转移病例的原发癌基因表达谱差异，筛选转移预后预测标志基因群，并探讨其用于乳腺癌患者预后分子分型的临床意义。方法以随访3年5例有远处转移和5例无远处转移的乳腺癌患者作为分析病例，采用含21329个人功能基因的Oligo芯片筛选预后不同的乳腺原发癌组织差异表达基因；基于差异表达基因分别对10例分析病例和另外20例验证病例进行k-mean聚类分析；利用逐一剔除法去除对聚类没有贡献的基因，得到可以预测乳腺癌患者转移和预后的标志基因群，用于乳腺癌患者预后的分子分型。结果利用10例不同预后的分析病例筛选得到的差异表达基因可以将30例乳腺癌患者分为预后良好和预后不良两个组；随访3年有远处转移的病例全部聚类在预后不良组，占该组的70．0％（7／10），而预后良好组中不含有远处转移的病例（0／20），两组3年内发生远处转移率的差异有统计学意义（P=0．03）。由104个基因组成的预后预测基因群中，5个与细胞黏附运动相关的基因在预后不良组较预后良好组均表达上调，2个与机体免疫应答相关的基因均下调，11个与细胞生长代谢相关的基因上调，14个与细胞生长代谢相关的基因下调，15个与细胞信号传导相关的基因表达量显著改变。结论通过乳腺癌有远处转移病例与无远处转移病例原发癌基因表达谱的比较研究，筛选得到可以预测乳腺癌患者转移和预后的基因群，且可反映高转移能力的乳腺原发癌中肿瘤细胞运动能力增强、机体免疫识别缺陷、细胞增殖活跃和信号传导异常的生物学特征，并能对乳腺癌患者进行预后分子分型，有望用于临床指导个体化治疗方案的选择。