近年来我国专利申请数量和授权数量激增,创新能力显著提升,但我国核心技术创新能力同国际先进水平相比还有很大差距。为研究财政补贴与税收优惠政策对专利产出和发明产出的影响,本文以2008～2016年中国高新技术上市公司为研究对象,运用面板泊松分布固定效应模型与面板负二项固定效应模型,实证分析研发财政补贴与税收优惠政策对企业创新产出结构的影响。研究发现,财政补贴与税收优惠对企业专利授权数量产生正面影响且税收优惠对专利产出的正面影响更大;而发明授权数量作为核心技术创新产出的代表,财政补贴与税收优惠对其影响并不显著。基于实证结果,本文从提高税收优惠对技术创新成果的创造性和新颖性要求,发挥税收政策保护知识产权、激励自主研发的作用,充分利用税收优惠激励创新人才,建立财政补贴和税收优惠的绩效评价体系等方面提出政策建议。