沙特番茄黄化曲叶病毒AC2基因编码蛋白的生物信息学分析

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该试验旨在通过生物信息学方法分析沙特番茄黄化曲叶病毒AC2基因编码的转录激活蛋白TrAP(transcriptional activator protein)的结构及功能。该文通过在线软件预测和分析了番茄中AC2基因编码蛋白的一级结构、二级结构、磷酸位点、糖基位点、三级结构及其重要的功能;通过最大似然法对不同物种AC2基因编码蛋白序列构建系统发育树,进行系统发育分析。结果表明:番茄中AC2基因共编码135个氨基酸,且编码蛋白属于不稳定的亲水性蛋白质;二级结构以无规则卷曲折叠为主,比例为58.52%;该蛋白
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