细菌、病毒之类的常见小儿腹泻已经介绍过不少，而另一些虽不多觅却也存在的小儿腹泻同样值得注意。这包括：
　　微绒毛包涵体病：是一种遗传性缺陷。临床上主要表现为小肠性水泻，患儿肠道缺乏吸收营养物质的能力，有肠腺分泌增多的现象。
　　改道性结肠炎：是一种医源性肠道炎性疾病，主要是因手术使粪便改道后引起的结肠闭锁段炎症。一般在改道后数周出现症状，腹泻呈间隙性，可隐匿多年，病变累及整个改道段或限于结肠，脓血便少见。
　　婴儿食饵性过敏性肠炎：是婴儿肠道对食饵过敏，因抗原抗体反应，使肠道壁发生炎症引起的腹泻。临床上以腹泻、腹痛多见。停服过敏食饵，腹泻症状可消失。服用强地松、地塞米松，有效率达97.2％。
　　隐孢子虫性肠炎：主要表现为顽固性腹泻，腹痛以脐周为主，伴有不同程度的贫血及营养不良，常迁延为慢性腹泻。用大蒜素胶囊治疗，效果满意。
　　乳糖不耐受症：近几年来有很多关于糖类在人体内不能正常消化和吸收的报告，尤以婴儿为甚。专家认为，该病是由于小肠微绒毛膜上的乳糖酶活性低下或缺乏，而导致未消化或吸收不良的糖形成高渗作用，使大量的水份被吸入肠腔内，而同时大肠内由于细菌对糖的发酵作用产生有机酸及气体，又影响结肠对水份的吸收，致使长期腹痛腹泻。该病治疗关键是从饮食中除去不能吸收的糖，一般是停乳两天，改吃米汤和营养米粉，10天就可康复。
　　气单胞菌性肠炎：气单胞菌为革兰氏阴性小杆菌，属弧菌科。该菌广泛存在于水和土壤中，当有外伤或食入被污染的食物时被感染。该菌是急性胃肠炎和败血症的重要病菌，对多种抗生素耐药，病情迁延反复。用氟哌酸和头孢酶素治疗效果较好。
　　原因未明的炎症性肠病：也称为胶原性结肠炎，是少见的病理综合征，以水样便、间歇性非血性水泻为特点，常有腹胀、腹绞痛、恶心呕吐，腹泻每日达20次以上。可试用柳氮磺胺吡啶治疗。
　　血小板激活因子性肠炎：血小板激活因子是一种内源性磷脂，由多种不同的炎性细胞所产生，在肠道中可引起严重的病理改变，诱发炎症反应。患者粪便中也可检出该因子。
　　肠凝聚性大肠杆菌性肠炎：是儿童持续性腹泻的一个病因，表现为肠道组织病理损害及绒毛严重变薄，有发烧、血便、呕吐和持续性腹泻。现可用探针诊断。