基于转录组SSR的三角梅遗传多样性分析

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为揭示三角梅的遗传背景,本研究采用软件MicroSAtellite搜索其苞片转录组SSR位点,使用Primer 5软件设计50对SSR引物,将筛选出的多态性引物用于55份三角梅材料的聚丙烯酰氨凝胶电泳,采用Popgene 32、PowerMarker V3.25和Structure等软件分析三角梅遗传多样性。结果显示,从50对SSR引物中筛选出25对条带清晰且多态性好的引物,25对SSR引物共检测到76个等位基因,平均每对引物有3个等位基因,平均有效等位基因数为2.30,引物多态性信息量(PIC)在0.01~0.66之间,均值为0.38。55个三角梅材料间的遗传距离为0.01~0.92,平均遗传距离为0.43;在遗传距离0.44处,聚类分析将55份材料分为3个群体。与印度三角梅栽培种比较而言,本实验研究的三角梅材料的遗传多样性水平不高,结果可为三角梅品种鉴定、保护及进化提供一定参考价值。
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