中波紫外线诱导的提前衰老成纤维细胞中环状RNA的表达及分析

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目的:对于中波紫外线诱导的提前衰老的人类真皮成纤维细胞(UVB stress induced premature senescence,UVB-SIPS),笔者使用基因芯片筛选了其中环状RNA的表达谱。方法:构建UVB-SIPS模型;采用β-gal染色、细胞周期、CCK8(cell counting kit)检测衰老成纤维细胞;基因芯片技术筛选差异表达的环状RNA;聚合酶链式反应验证相关环状RNA;利用Clusterprofiler r package,对上下调基因分别进行KEGG和GO的富集分析。结果:与对照组比较(差异表达倍数≥1.5,P<0.05),共有472个差异表达的环状RNA,其中228个环状RNA上调,244个环状RNA下调。在472个差异表达的环状RNA中随机选择了8个环状RNA进行聚合酶链式反应。其中有5个环状RNA(hsacirc RNA100797,hsacirc RNA100686,hsacirc RNA400036,hsacirc RNA101755,hsacirc RNA003794)与基因芯片的结果一致。GO分析显示,UVB-SIPS组细胞中差异表达的环状RNA亲本基因与细胞对紫外线辐射的反应、DNA修复复合物、有丝分裂、微管蛋白结合等注释条目有关;KEGG分析显示,UVB-SIPS组细胞与未处理组细胞相比,差异表达的环状RNA的亲本基因可能参与与衰老相关的细胞周期、p53信号通路、PPAR信号通路等的调节。结论:本研究初步揭示了提前衰老的人类真皮成纤维细胞中环状RNA的表达,可为未来研究光老化发生机制奠定基础。
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