【摘 要】
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为探究青海湖裸鲤（Gymnocypris przewalskii）的种质资源现状，为该物种保护措施的制定提供参考依据。首次利用基因分型技术（Genotyping-by-sequencing, GBS），对青海湖水域的6个地理群体共72尾青海湖裸鲤进行单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism, SNP）标记开发和遗传特征分析。共检测出1 600 061个SNP位点
【基金项目】
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国家重点研发计划项目（2019YFD0900604）； 西北地区重点水域渔业资源与环境调查专项青海湖渔业资源与环境调查（XB2019-2021）； 中国水产科学研究院基本科研业务费专项资金（2020TD61）；
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为探究青海湖裸鲤（Gymnocypris przewalskii）的种质资源现状，为该物种保护措施的制定提供参考依据。首次利用基因分型技术（Genotyping-by-sequencing, GBS），对青海湖水域的6个地理群体共72尾青海湖裸鲤进行单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism, SNP）标记开发和遗传特征分析。共检测出1 600 061个SNP位点，质控后筛选出45 266个高质量的SNP位点用于遗传分析，发现核苷酸多样性（Pi）为0.317 0～0.327 4，观测杂合度（Ho）和期望杂合度（He）分别为0.459 4～0.482 3和0.336 7～0.344 4。6个地理群体的遗传距离（D）为0.018 4～0.023 3，两两群体的遗传分化系数（Fst）均不显著（P＞0.05）。分子方差分析（Analysis of molecular variances, AMOVA）显示102.37%的遗传变异来自群体内；群体遗传结构和系统发育进化树分析均显示6个群体属于一个集群，具有遗传同质性；而主成分判别分析（Discriminant analysis of principal components, DAPC）表明哈尔盖河、黑马河和沙柳河群体相互交叉聚类，其余3个地理群体分别聚类。综上，6个青海湖裸鲤群体的Ho均大于He，种群结构单一。
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