鹦鹉热衣原体MIP蛋白生物信息学分析

来源 :基因组学与应用生物学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lqgomqj
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为初步了解鹦鹉热衣原体(Chlamydia psittaci,Cps)巨噬细胞感染增强蛋白(macrophage infection po-tentiator,MIP)的生物学特征.本研究从美国国家生物技术信息中心(national center for biotechnology infor mation,NCBI)数据库中检索并下载全部Cps菌株的MIP基因序列,运用生物信息学软件分析Cps不同菌株间MIP基因的同源性,MIP蛋白的氨基酸序列、理化性质、跨膜区、信号肽、空间结构以及抗原表位.结果 显示:MIP基因在Cps不同菌株间的同源性为98.96%~99.87%.生物信息学软件预测MIP蛋白为一种性质不稳定、弱酸性的亲水蛋白;该蛋白无跨膜区和信号肽;α螺旋与β转角是其主要结构特征;该蛋白含有5个优势B细胞抗原表位,2个优势T细胞抗原表位.Cps MIP为弱酸性、亲水性且不参与物质运输的蛋白,具有优势B、T淋巴细胞抗原表位,是良好的潜在疫苗.
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