基于mt COI、Cyt b、D-loop序列的南方多鳞鱚群体遗传结构分析

来源 :水生态学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiaotian521
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分析中国南部沿海多鳞鱚4个野生群体的遗传多样性,为多鳞鱚种质资源保护及合理开发利用提供理论参考。基于线粒体COI、Cyt b、D-loop基因序列对福建厦门(XM)、广东阳江(YJ)、海南海口(HK)和广西北海(BH)的4个多鳞鱚(Sillago sihama)群体进行遗传结构分析。经PCR扩增和测序获得4个多鳞鱚群体195条线粒体COI+Cyt b+D-loop片段序列。结果表明,单倍型多样性指数(Hd)为0.88266~0.98785,核苷酸多样性指数(π)为0.00098~0.00257,整体Hd与π分别为0.92784和0.00158。遗传分化系数(Fst)和基因流(Nm)分别为0.00075~0.14888和1.429205~333.0833。将4个地理群体分成不同组合进行AMOVA分子方差分析,结果显示,4个群体内变异比例为93.33%,南海群体和东海群体的组内变异比例为86.57%,琼州海峡东西群体的组内变异比例为94.49%。基于COI、Cyt b和D-loop的分析结果,厦门群体和北海、海口、阳江群体间存在中等程度的遗传分化,可作为两个管理保护单位进行保护。
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