水稻外源DNA导入变异系与受体的农艺性状差异及其基因变异分析

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野威B是将小粒野生稻基因组DNA通过穗茎注射法导入杂交水稻保持系V20B后创造的变异系,其在株型、稻米品质和产量相关性状上都发生了明显变化。通过全基因组测序,比较分析了野威B与V20B中27个可能与变异性状有关的基因,发现野威B在与株型相关的基因中存在21个SNP和30个InDel,其中有10个SNP和4个InDel位于编码序列;在稻米品质相关的基因中存在124个SNP和28个InDel,其中25个SNP位于编码序列;在产量相关基因中存在65个SNP和42个InDel,其中有10个SNP和2个InDel位于编码序列。位于编码序列的变异中,有24个SNP为错义突变,导致部分编码氨基酸的极性或电荷状态改变,有4个InDel变异为移码突变,导致编码的氨基酸序列改变。为寻找引起变异系野威B表型变化的关键基因及位点提供依据。 Wild Granville B was transformed by introduction of genomic DNA of small wild rice into the hybrid rice maintainer line V20B by means of ear-stem injection, which had obvious changes in plant type, grain quality and yield-related traits. Through genome-wide sequencing, 27 genes that may be related to the variation traits in wild Wei B and V20B were comparatively analyzed. It was found that there were 21 SNPs and 30 InDel in wild-type B related to plant type, of which 10 SNPs There were 124 SNPs and 28 InDels in rice quality-related genes, of which 25 SNPs were located in the coding sequence. There were 65 SNPs and 42 InDel in the yield-related genes, of which 10 The SNP and 2 InDels are located in the coding sequence. In the variation of the coding sequence, 24 SNPs were missense mutations, leading to changes in the polarity or charge state of some of the encoded amino acids. Four InDel mutations were frameshift mutations, leading to changes in the encoded amino acid sequence. To find the mutation caused by wild Weiwei B phenotypic changes in the key genes and sites provide the basis.
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