【摘 要】
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目的 探讨条件高斯贝叶斯网络(conditional Gaussian Bayesian network,CGBN)在代谢组学数据的分类判别中的应用.方法 通过模拟研究与实际代谢组学数据分析,比较CGBN与偏最小二乘判别分析(partial least squares discriminant analysis,PLSDA)在不同相关程度和不同稀疏水平的高维数据及线性相关与非线性等情形时的分类判别性能,评价指标采用ROC曲线下面积(area under curve,AUC)和平均计算时间.结果 模拟研究结
【机 构】
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东南大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系 210009;温州医科大学附属第二医院、育英儿童医院质量管理处;东南大学公共卫生学院环境医学工程教育部重点实验室
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目的 探讨条件高斯贝叶斯网络(conditional Gaussian Bayesian network,CGBN)在代谢组学数据的分类判别中的应用.方法 通过模拟研究与实际代谢组学数据分析,比较CGBN与偏最小二乘判别分析(partial least squares discriminant analysis,PLSDA)在不同相关程度和不同稀疏水平的高维数据及线性相关与非线性等情形时的分类判别性能,评价指标采用ROC曲线下面积(area under curve,AUC)和平均计算时间.结果 模拟研究结果表明,变量之间低相关且样本量不大于200时CGBN分类判别AUC高于PLSDA.在自变量与因变量非线性相关且小样本情况下CGBN分类判别AUC同样高于PLSDA.实例数据分析结果显示CGBN和PLSDA分类判别的AUC分别为0.997,0.975.CGBN的计算时间要远高于PLSDA.结论 在不受计算负担限制的情形下,CGBN是代谢组学数据典型分析方法的一种可行的替代方法,值得进一步研究.
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