流域治理作为跨区域生态环保事业，离不开政府支持，但市场机制的普遍缺位影响了激励与问责的有效性，也阻碍了生态价值的充分实现。当前，亟须探索政企深度合作的“准市场化”机制，来破解治理碎片化、运营效率低、收益平衡难等痛点，切实提升治理的系统效率与综合效益，将生态优势转化为“金山银山”。核心是要探索政府与市场协同发力这一“准市场化”下的治理机制和运作模式，提升流域运营效率和“造血”能力，形成综合治理、生态修复与生态产品价值实现的投入与产出的良性闭环。其中，应重视多主体协调为引领、资本联合为纽带的组织方式创新，形成“投、建、管、运”一体化运作，发挥“专业的人干专业的事”和激励相容机制作用，形成跨时空资金平衡和高效溢价回收。积极探索生态环境导向开发（EOD）、全要素统筹一体化开发等“准市场化”机制，将生态环境治理与资源开发、资产经营、产业发展有机结合，进行系统谋划和综合平衡。目前流域治理仍存在一定体制机制障碍，未来应继续创新政策，完善市场机制，加强治理模式、资源产权、生态补偿、绿色金融、生态产品价值实现等协同改革。