基于转录组测序技术研究当归与5种重要经济作物的序列相似性

来源 :广州中医药大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mhy8348
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【目的】基于转录组测序技术研究当归与5种重要经济作物的序列相似性,为当归栽培、鉴定、加工、配伍及开发提供理论支持。【方法】岷县现场采集当归样品,并经专家鉴定为当归品种[Angelica sinensis(oliv.)diels]。采用RNA plant Plus方法提取岷归头、岷归尾的总RNA,质量鉴定合格后构建测序文库。测序文库检测合格后在Illummina HiSeq 2000测序仪上完成双端测序。采用相关生物信息学分析软件,实现研究目标。【结果】通过转录组测序技术,获取了63 585个当归表达序列标签(EST),并在UniProt(date:2012.09)数据库中注释了30 432个当归基因,均分布于939种物种;其中序列分布频率较高的前5种物种分别为葡萄、蓖麻、毛果杨、大豆、苜蓿属。【结论】已注释基因主要分布于目前研究较深入的5种重要经济植物,成为当归制剂开发的分子生物学基础。
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