拟黑多刺蚁RACK1基因cDNA克隆及其生物信息学分析

来源 :基因组学与应用生物学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:uirerhj
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活化的蛋白激酶C受体1 (receptor for activated C kinase 1,RACK1)在动物胚胎发育以及细胞内多种激酶活性调节等过程中起着重要作用.为了进一步探讨不同物种RACK1基因及其表达产物的特点,以昆虫拟黑多刺蚁为实验材料,通过RT-PCR、基因克隆及测序等技术获得了RACK1基因cDNA序列,并对该序列和表达产物的序列进行了生物信息学分析.研究发现,拟黑多刺蚁RACK1基因cDNA长度为1 096 bp,其编码区序列(CDS)长度为954 bp,编码317个氨基酸,构成RACK1.拟黑多刺蚁RACK1蛋白中酸性氨基酸和碱性氨基酸数量分别是34和35,理论等电点为7.63.该蛋白与多个物种RACK1或G蛋白β亚基类似物是同源的,具有典型的WD40蛋白家族结构域,其二级结构主要由β折叠和无规则卷曲构成,并由此形成螺旋桨状的高级结构.
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