为了给湖北省枫香资源的保护与利用提供科学依据，选取湖北省远安（YA）、红安（HA）、赤壁（CB）、竹溪（ZX）、南漳（NZ）、利川（LC）和武汉（WH）的枫香资源为研究对象，并以安徽黄山（HS）、重庆丰都（FD）、江西铜鼓（TG）和海南霸王岭（BWL）的枫香资源为对照，采用ISSR分子标记对这11个枫香群体的335份个体样品进行了遗传多样性分析。结果表明：（1）湖北省7个枫香群体的215份样本共扩增得到334个条带，其中多态性条带306条。群体内的遗传变异为84.19%，群体间遗传变异为15.81%，基因流（Nm）为2.663 3。在群体内部，HA和WH的遗传多样性最丰富，ZX的遗传多样性最低。ZX和LC的亲缘关系最近，YA和LC的亲缘关系最远。当遗传相似系数为0.94时，可将7个群体分为4个大类，NZ、LC和ZX群体聚为一类，YA和WH群体聚为一类，HA群体、CB群体分别单独聚为一类。（2）11个枫香群体共扩增出349个条带，其中多态性条带320个，平均多态性百分比为91.69%。不同群体的多态位点百分率范围为54.29%～77.14%，平均值为67.01%。WH和HA的遗传多样性最丰富，BWL的遗传多样性最低。11个群体中，18.01%的遗传变异存在于群体间，群体内的遗传变异为81.99%，基因流（Nm）为2.276 5。在群体内部，HA和WH的遗传多样性最丰富，BWL的遗传多样性最低。遗传相似度和遗传距离均显示，ZX和TG的亲缘关系最近，TG和BWL的亲缘关系最远。当遗传相似系数为0.93时，可将11个群体分为四大类：第1类包括NZ、ZX、TG和LC；第2类包括FD、HA和CB；第3类包括YA、WH和HS；第4类是BWL单独一类。可见湖北省7个枫香群体的聚类结果与其自然地理分布大致吻合，可分为东部、中部和西部三大类；4个省外枫香群体中，除BWL单独聚成一类外，其余3个群体（TG、FD和HS）并未与湖北省内地理位置临近的群体聚为一类。