【摘 要】
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对一株溶藻弧菌噬菌体φV039C进行了生物学特性和全基因组序列的研究.经透射电镜观察可见,噬菌体φV039C头部为正廿面体结构,直径58.9 nm,具长105.2 nm的尾部;采用双层平板法检测,其最佳感染复数为0.1;通过一步生长曲线计算可得,噬菌体 φV039C的潜伏期为20 min,爆发期为10 min,裂解量为163 pfu/cell;利用第三代单分子测序平台进行全基因组测序分析,其基因组全长43405 bp,G+C含量为42.95％,74个开放阅读框(ORF)主要为噬菌体的结构、DNA复制和裂解
【机 构】
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集美大学水产学院,福建 厦门361021;厦门市渔用药物工程技术研究中心,福建 厦门361021;广西水产科学研究院,广西 南宁530021;广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,广西 南宁53002
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对一株溶藻弧菌噬菌体φV039C进行了生物学特性和全基因组序列的研究.经透射电镜观察可见,噬菌体φV039C头部为正廿面体结构,直径58.9 nm,具长105.2 nm的尾部;采用双层平板法检测,其最佳感染复数为0.1;通过一步生长曲线计算可得,噬菌体 φV039C的潜伏期为20 min,爆发期为10 min,裂解量为163 pfu/cell;利用第三代单分子测序平台进行全基因组测序分析,其基因组全长43405 bp,G+C含量为42.95％,74个开放阅读框(ORF)主要为噬菌体的结构、DNA复制和裂解有关的基因;在NCBI数据库中进行基因组比对,发现与其最接近的长尾噬菌体科的溶藻弧菌噬菌体NF和副溶血弧菌噬菌体Seahorse的覆盖率仅为11％(覆盖区域的相似度分别为92.2％和93.3％),此外,基于裂解酶构建的系统进化树也表明,φV039C与二者处于距离最近的分支.由此得出,溶藻弧菌噬菌体φV039C是一株新型的噬菌体,分类上应归属有尾噬菌体目长尾噬菌体科.
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