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目的
分析一例临床表现疑似德朗热综合征的男性患儿的遗传学病因。
方法采集患儿的外周血样进行染色体核型分析，基因组拷贝数变异测序(copy number variation sequencing，CNV-seq)检测及全外显子组测序(whole exome sequencing，WES)检测。同时采集其父母外周血样，对患儿核型、基因组拷贝数、全外显子异常的疑似致病性变异行家系验证。
结果患儿临床表现为发育落后、小头畸形、上睑下垂、小颌畸形、低耳位，临床诊断为疑似德朗热综合征(Cornelia de Lange syndrome，CdLS)。其染色体核型分析及CNV-seq检测结果未见异常，全外显子组测序检测显示存在5个杂合变异和1个X染色体半合子变异。根据遗传模式和家系验证结果，SMC1A基因c.3500T>C(p.Ile1167Thr)半合子变异为患儿临床表现的遗传学病因。该变异在dbSNP数据库及gnomAD数据库中未见收录，PolyPhen2, PROVEAN, SIFT软件预测为有害变异，PhastCons保守性预测为保守。ACMG变异分类标准证据支持为PM2、PP2和PP3。
结论新发现的SMC1A基因c.3500T>C(p.I1167T)错义变异为患儿临床表现的遗传学病因，该患儿为CdLS综合征Ⅱ型(温和型)。本研究的结果丰富了CdLS综合征Ⅱ型的变异谱，为临床咨询提供了数据支持。