随着农业经济发展，人类及其他动植物等的活动为外源微生物在食物链、环境介质中传播创造了条件，造成外源微生物频繁流动并对土壤生态系统产生扰动，进而引发微生物入侵。为了解国内外微生物入侵相关研究进展，本文利用CiteSpace、VOSviewer及HistCite对Web of Science核心合集数据库中微生物入侵领域的主要研究热点及其变化趋势等进行计量分析。结果表明：微生物入侵相关研究文献数量逐年上升，受到的关注度越来越高；美国、中国、德国、印度、澳大利亚等国家在该领域发文量居前列，且具有较紧密的国际学术合作网络；高通量测序与宏基因组为核心的微生物测定分析技术的快速发展，使得微生物入侵成为研究热点，当前的研究文献集中于根际促生菌作用机制、根际微生物群与植物健康等方面。研究指出有益微生物入侵可有效防治植物病害、促进植物生长以及修复污染土壤等，但病原微生物入侵土壤可造成作物减产、质量下降，甚至可经食物链传播而威胁人类及其他动物的健康，因此微生物入侵的影响与入侵菌株性质紧密相关。未来研究趋势主要集中于入侵微生物与特异性土著微生物的相互作用关系、植物病原微生物的防控机制与技术应用等方面，以期为土壤健康与绿色农业生产提供理论依据。